应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 使用BLAST序列比对问题
汕头大学海洋科学接受调剂
51/1返回列表
查看: 1214  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

devil2006

木虫 (正式写手)

[交流] 使用BLAST序列比对问题

本人初次做BLAST序列比对，做菌种鉴定，比对结果显示有好几种菌的同源性都在99%以上，请问我应该选那一个？还是应该在做什么处理？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-01-16 16:51:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qqsvery

木虫 (著名写手)
★ ★
devil2006(金币+1):谢谢参与
devil2006(金币+1,VIP+0):非常感谢！ 12-9 08:11
这个要看你自己的序列是多长，再看你比对出来的序列有多长。比如你的是1430，你查出来的是1450，比你自己的长20，你就要看Query （这个是你自己的序列）和Sbjct （这个是你比对出来的）是不是分别以1开头，如果Sbjct 不是1，而是别的，就说明是比对出来的序列在5·端比你自己的序列长。

你所说的：778/780 (99%),有的是774/777 (99%),就要看上面这个了！
赞一下(2人) 回复此楼
谎言和真实在河边洗澡，谎言先洗好，穿走了真实的衣服，真实却不肯穿谎言的衣服。后来人们眼里只有穿着真实衣服的谎言，却很难接受赤裸裸的真实。
9楼2009-12-08 11:42:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

devil2006

木虫 (正式写手)
可是有好几个都是同源性100%，那我该选那你个呢？
赞一下 回复此楼
3楼2009-01-16 18:37:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mylove0xy03

禁虫 (小有名气)
★ ★
devil2006(金币+1):谢谢参与
devil2006(金币+1,VIP+0):感谢
本帖内容被屏蔽
4楼2009-01-16 20:01:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

devil2006

木虫 (正式写手)
Score = 1431 bits (744),  Expect = 0.0
Identities = 778/780 (99%), Gaps = 0/780 (0%)
Strand=Plus/Minus

Score = 1413 bits (735),  Expect = 0.0
Identities = 774/777 (99%), Gaps = 1/777 (0%)
Strand=Plus/Plus

请问测序结果中以上内容说明了什么？为什么有的是 778/780 (99%),有的是774/777 (99%),同源性都是99%，像这种情况该选哪一个呢？
赞一下 回复此楼
5楼2009-01-16 20:31:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 药学305求调剂 +6 玛卡巴卡boom 2026-04-11 6/300 2026-04-14 19:48 by zhouxiaoyu
[基金申请] 山东省基金2026 +6 jerry681 2026-04-08 8/400 2026-04-14 19:28 by laobibibi
[考研] 求调剂 +20 MAX怅惘 2026-04-09 22/1100 2026-04-14 14:57 by 独醉梦孤城
[考研] 105500药学求调剂 +4 x_skys 2026-04-12 4/200 2026-04-14 13:37 by rndfc
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +24 叶zilin 2026-04-13 25/1250 2026-04-14 09:20 by 试管破裂
[考研] 293求调剂 +16 我爱高数高数爱� 2026-04-12 18/900 2026-04-13 21:47 by 学员JpLReM
[考研] 一志愿0807 数一英一 313 有没有二轮调剂 +12 emokidd 2026-04-08 13/650 2026-04-13 08:32 by lhj2009
[考研] 344 材料专业 求调剂211 无地域要求 +8 hualkop 2026-04-11 8/400 2026-04-12 22:24 by fqwang
[硕博家园] 新一代电子信息294求调剂 不挑学校 +7 Ytyt11 2026-04-09 8/400 2026-04-12 16:57 by ajpv风雷
[考研] 电气专硕320求调剂 +6 小麻子111 2026-04-10 6/300 2026-04-12 10:54 by lemon6009
[考研] 11408。358求调剂 +3 TMYzds 2026-04-07 3/150 2026-04-11 17:10 by 氮气气气
[考研] 0854调剂 +8 950824he@ 2026-04-09 8/400 2026-04-11 10:11 by zhq0425
[考研] 22408 327分求调剂 +4 韵风kon 2026-04-10 4/200 2026-04-11 09:51 by 猪会飞
[考研] 311求调剂 +13 xyp想读书 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:41 by 猪会飞
[考研] 263能源动力专硕求调剂 +3 加大号饭盒袋 2026-04-10 3/150 2026-04-10 22:23 by 286640313
[考研] 083200 305分 求二轮调剂 不接受跨专业 +9 Claireyyyy 2026-04-09 10/500 2026-04-10 21:21 by Claireyyyy
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +6 白云123456789 2026-04-09 8/400 2026-04-10 21:13 by zhouxiaoyu
[考研] 265求调剂 +12 风说她早忘了 2026-04-10 13/650 2026-04-10 18:56 by chemisry
[考研] 求机械专硕297第二批调剂 +5 拾柒12。 2026-04-08 5/250 2026-04-09 16:43 by 允当适度
[考研] 0860004 求调剂 309分 +6 Yin DY 2026-04-09 6/300 2026-04-09 10:19 by 啊李999
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭