24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 232  |  回复: 2
当前主题已经存档。

hxsj

木虫 (正式写手)

[交流] 请教蛋白质结构预测

我是新手,听说有些网站可以做免费的蛋白质结构预测,查了一些不太会用,哪位大侠做过,哪个网站简单好用一些呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

★ ★
hxsj(金币+2,VIP+0):非常感谢
swiss-model
http://swissmodel.expasy.org/SWISS-MODEL.html
这个很简便的
做蛋白结构预测这网站采用的是同源建模的方法
在你已知你的蛋白序列时,你可以提交后点选Alignment Interface 即可利用数据库内自有的模板进行建模。
当同源性大于30%时结果比较可信
但是由这个得出的蛋白模型是很粗糙的,需要进一步的处理,你可以上计模-药物设计板块看看,那边有很多高人
2楼2009-01-14 21:04:09
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hxsj

木虫 (正式写手)

感谢帮助,具体情况是这样的。我现在手头自己表达了一个蛋白,和PDB中的一个同样蛋白相比,N端比它多了大概几十个氨基酸,其他几乎相同。我想预测出我的蛋白的二级结构和三级结构,但是在swiss model上面做了之后只能给出同源性部分的模型,在predictprotein又只能得到二级结构的信息。在这里请教大家,我怎么才能得到前端多出来的几十个氨基酸的结构以及对整体结构的影响,或者是整个蛋白3D方面的信息。有什么网站或者是软件可以做这件事吗?先谢谢楼上的以及大家了。
3楼2009-02-18 16:14:38
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hxsj 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
[考研] 0703化学338求调剂! +5 Zuhui0306 2026-03-26 6/300 2026-03-26 23:42 by 381988266
[考研] 311求调剂 +5 lin0039 2026-03-26 5/250 2026-03-26 22:43 by 学员8dgXkO
[考研] 调剂 +4 柚柚yoyo 2026-03-26 4/200 2026-03-26 20:43 by fmesaito
[考研] 求调剂 +6 白QF 2026-03-21 6/300 2026-03-26 20:37 by fmesaito
[考研] 0703化学求调剂 +3 丹青奶盖 2026-03-26 5/250 2026-03-26 20:11 by macy2011
[考研] 一志愿厦门大学化学学硕307求调剂 +8 y7czhao 2026-03-26 8/400 2026-03-26 19:51 by 不吃魚的貓
[考研] 279求调剂 +6 红衣隐官 2026-03-21 6/300 2026-03-26 18:32 by 不吃魚的貓
[考研] 271求调剂 +6 生如夏花… 2026-03-22 6/300 2026-03-26 16:48 by 张凯十八号
[考研] 一志愿北京化工大学材料与化工(085600)296求调剂 +9 稻妻小编 2026-03-26 9/450 2026-03-26 16:16 by 不吃魚的貓
[考研] 调剂310 +3 温柔的晚安 2026-03-25 4/200 2026-03-25 23:16 by peike
[考研] 一志愿哈工大,085400,320,求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 材料求调剂 +4 .m.. 2026-03-25 4/200 2026-03-25 21:30 by peike
[考研] 347求调剂 +4 L when 2026-03-25 4/200 2026-03-25 13:37 by cocolv
[考研] 调剂 +4 13853210211 2026-03-24 4/200 2026-03-24 19:44 by ms629
[考研] 一志愿北京化工大学 070300 学硕 336分 求调剂 +7 vv迷 2026-03-22 7/350 2026-03-23 23:44 by Txy@872106
[考研] 一志愿国科过程所081700,274求调剂 +3 三水研0水立方 2026-03-23 3/150 2026-03-23 23:11 by MajorWen
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 一志愿深大,0703化学,总分302,求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
信息提示
请填处理意见