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staventchoke

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 径向分布函数与范德华力分析已有2人参与

请问MS分子模拟高手,能够通过径向分布函数曲线表现出原子间距离信息来分析原子间的范德华力。
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chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
横坐标截距表示分子或者粒子之间的最小距离!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2017-06-09 21:33:19
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chuntao118

新虫 (著名写手)

当然可以!径向分布函数取负对数,与分子间平均力势直接相关的,我在手机上没办法打出具体公式!你可以网上查一下!

发自小木虫Android客户端
6楼2017-06-10 08:27:16
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chuntao118

新虫 (著名写手)

这很简单你只要有径向分布函数的信息!手算也能解决。我是自己编程,不用软件,不懂软件!但是,我认为软件肯定能解决这个小问题!就是一个数学变换!

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

8楼2017-06-10 08:40:07
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chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
staventchoke(abinitio代发): 金币+10, 感谢应助 2017-06-11 06:50:01
abinitio: 金币+10, 精彩应助 2017-06-11 06:50:39
引用回帖:
9楼: Originally posted by staventchoke at 2017-06-10 08:52:44
好吧,什么时候您在线,当面指点下,谢谢!
...

你 是不是没有找到对应的关系式呀?给你个参考文献吧!我相信你只要知道这个公式了就解决这个问题了
这个文章中有那个公式Transport properties and structure of dense methane fluid in the rough nano-channels using non-equilibrium multiscale molecular dynamics simulation你自己找一下,要是还解决不了的话,晚上8点左右吧!
10楼2017-06-10 10:50:19
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chuntao118

新虫 (著名写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by staventchoke at 2017-06-10 18:42:49
你好,文章下载后,我看了下,不过没有涉及到径向分布函数与范德华力之间的关系的。请指点。...

平均力势“potential of mean force”找到这个,后面有平均力势和径向分布函数的关系,平均力势的意义“The potential of mean force can be obtained in Monte Carlo or Molecular Dynamics simulations which examines how a system's energy changes as a function of some specific reaction coordinate parameter”.因此,你可据此来解释你的问题。因为能量对位移的微分就是力!
12楼2017-06-10 20:14:20
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chuntao118

新虫 (著名写手)

引用回帖:
13楼: Originally posted by staventchoke at 2017-06-11 09:36:51
谢谢,我看过了正篇文章,不过没有并没哟提及the potential of mean force 与rdf之间的关系,也没有提及您刚才讲的那个定义。是不是在另外一篇文献上呀。...

你没认真看,在文章中我只是用了它们的关系,W(r)=-k_BT ln(g(r)),在文章2.1最后一段里面。关于它的意义自己看一下百科解释!
14楼2017-06-11 15:29:40
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