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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 径向分布函数与范德华力分析
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staventchoke

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 径向分布函数与范德华力分析 已有2人参与

请问MS分子模拟高手，能够通过径向分布函数曲线表现出原子间距离信息来分析原子间的范德华力。
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大叔、博士、单身
1楼 2017-06-08 20:42:59
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
staventchoke(abinitio代发): 金币+10, 感谢应助 2017-06-11 06:50:01
abinitio: 金币+10, 精彩应助 2017-06-11 06:50:39
引用回帖:
9楼: Originally posted by staventchoke at 2017-06-10 08:52:44
好吧，什么时候您在线，当面指点下，谢谢！
...

你 是不是没有找到对应的关系式呀？给你个参考文献吧！我相信你只要知道这个公式了就解决这个问题了
这个文章中有那个公式Transport properties and structure of dense methane fluid in the rough nano-channels using non-equilibrium multiscale molecular dynamics simulation你自己找一下,要是还解决不了的话，晚上8点左右吧！
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10楼2017-06-10 10:50:19
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chuntao118

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
横坐标截距表示分子或者粒子之间的最小距离！
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staventchoke
2楼2017-06-09 21:33:19
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普通回帖

staventchoke

铁杆木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by chuntao118 at 2017-06-09 21:33:19
横坐标截距表示分子或者粒子之间的最小距离！

请问通过rdf曲线可以分析粒子间的分子间作用力么？

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大叔、博士、单身
3楼2017-06-09 21:45:36
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by staventchoke at 2017-06-09 21:45:36
请问通过rdf曲线可以分析粒子间的分子间作用力么？
...

分子间作用力是与两原子距离有关的，势函数。
rdf也是与两原子距离有关的，但这是一个统计的量
所以，我想不明白为什么要通过rdf得到分子间作用力？
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staventchoke
4楼2017-06-10 06:59:23
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staventchoke

铁杆木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by abinitio at 2017-06-10 06:59:23
分子间作用力是与两原子距离有关的，势函数。
rdf也是与两原子距离有关的，但这是一个统计的量
所以，我想不明白为什么要通过rdf得到分子间作用力？...

小论文的审稿人提出的建议，通过rdf分析范德华力与氢键，我也为难，氢键可以分析，但是根范德华力扯不上关系吧，所以请教高手呀。

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大叔、博士、单身
5楼2017-06-10 07:53:53
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chuntao118

新虫 (著名写手)
当然可以！径向分布函数取负对数，与分子间平均力势直接相关的，我在手机上没办法打出具体公式！你可以网上查一下！

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6楼2017-06-10 08:27:16
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staventchoke

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by chuntao118 at 2017-06-10 08:27:16
当然可以！径向分布函数取负对数，与分子间平均力势直接相关的，我在手机上没办法打出具体公式！你可以网上查一下！

嗯，不过在MS模拟软件上能搞出来吗？求教

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大叔、博士、单身
7楼2017-06-10 08:36:47
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chuntao118

新虫 (著名写手)
这很简单你只要有径向分布函数的信息！手算也能解决。我是自己编程，不用软件，不懂软件！但是，我认为软件肯定能解决这个小问题！就是一个数学变换！

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staventchoke
8楼2017-06-10 08:40:07
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staventchoke

铁杆木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by chuntao118 at 2017-06-10 08:40:07
这很简单你只要有径向分布函数的信息！手算也能解决。我是自己编程，不用软件，不懂软件！但是，我认为软件肯定能解决这个小问题！就是一个数学变换！

好吧，什么时候您在线，当面指点下，谢谢！

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大叔、博士、单身
9楼2017-06-10 08:52:44
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