应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 求助，做了一个晶格匹配的模型
51/1返回列表
查看: 1778  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

jzjy1994

新虫 (小有名气)

[求助] 求助，做了一个晶格匹配的模型 已有1人参与

想用ms里面layer and layer 做一个晶格匹配的模型。想问一下，我需要对切割出来的面进行一个加氢来去除他的悬挂键以及平衡他的电荷吗
另外就是我需要在界面之间加真空层吗，因为感觉layer and layer 给出的距离挺好的，所以一直没有加
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理杂

» 猜你喜欢
1楼 2017-06-07 21:32:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangfrank

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
jzjy1994: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2017-06-09 15:38:54
引用回帖:
3楼: Originally posted by jzjy1994 at 2017-06-09 15:04:33
您好，我想问一下。首先改变初始距离是用layer details 里面的vacuum来调吗。
其次=。=那个切出来的面，我点adjust hydrogen好像没什么反应==。（这里其实挺疑惑地，因为切出来的是晶面，他还是有属于他的周期性所 ...

"首先改变初始距离是用layer details 里面的vacuum来调吗。"
》》》不是，是你选中一个表面，自己move

加H是自己手动加，我没有用过adjust H. 我用的是build-add atom输入原子坐标

build surface只是一个表面（只是2d的一个模型，没有真空）。crystal是一个晶体（具有3d的空间对称性了。另外这个晶体可以有真空可以没有真空）

可以不一样 自己酌情选择
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

迷Fy
计算顺利点吧
4楼2017-06-09 15:16:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

zhangfrank

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
需要对切割出来的面进行一个加氢来去除他的悬挂键以及平衡他的电荷

不需要在界面之间加真空层，但是需要在layer之间的初始距离做调整，也就是改变初始距离算静态能量选择最低能量的gap
赞一下 回复此楼
计算顺利点吧
2楼2017-06-09 12:38:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jzjy1994

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangfrank at 2017-06-09 12:38:17
需要对切割出来的面进行一个加氢来去除他的悬挂键以及平衡他的电荷

不需要在界面之间加真空层，但是需要在layer之间的初始距离做调整，也就是改变初始距离算静态能量选择最低能量的gap

您好，我想问一下。首先改变初始距离是用layer details 里面的vacuum来调吗。
其次=。=那个切出来的面，我点adjust hydrogen好像没什么反应==。（这里其实挺疑惑地，因为切出来的是晶面，他还是有属于他的周期性所以旁边的悬挂键好像去除不掉，所以一直在想那个要不要去除）
另外就是build surface  和crystal 有什么区别吗。
最后就是我结构优化时所用的参数和计算性质所用的参数可以不一样吗。谢谢你了-0-
赞一下 回复此楼
3楼2017-06-09 15:04:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jzjy1994

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangfrank at 2017-06-09 15:16:00
"首先改变初始距离是用layer details 里面的vacuum来调吗。"
》》》不是，是你选中一个表面，自己move

加H是自己手动加，我没有用过adjust H. 我用的是build-add atom输入原子坐标

build surface ...

谢谢你了
回复此楼
5楼2017-06-09 15:39:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +31 医学老男孩 2026-08-13 68/3400 2026-08-15 23:19 by 医学老男孩
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +12 archvillain 2026-08-15 23/1150 2026-08-15 20:47 by foyo404
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +12 Tide man 2026-08-10 13/650 2026-08-15 16:34 by 氺木
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[硕博家园] 读博的好处 +4 lnee 2026-08-11 4/200 2026-08-14 10:20 by ahsoarli
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源：本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 确定了，国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭