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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 求助，做了一个晶格匹配的模型
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jzjy1994

新虫 (小有名气)

[求助] 求助，做了一个晶格匹配的模型 已有1人参与

想用ms里面layer and layer 做一个晶格匹配的模型。想问一下，我需要对切割出来的面进行一个加氢来去除他的悬挂键以及平衡他的电荷吗
另外就是我需要在界面之间加真空层吗，因为感觉layer and layer 给出的距离挺好的，所以一直没有加
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1楼 2017-06-07 21:32:21
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zhangfrank

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
需要对切割出来的面进行一个加氢来去除他的悬挂键以及平衡他的电荷

不需要在界面之间加真空层，但是需要在layer之间的初始距离做调整，也就是改变初始距离算静态能量选择最低能量的gap
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计算顺利点吧
2楼2017-06-09 12:38:17
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jzjy1994

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhangfrank at 2017-06-09 12:38:17
需要对切割出来的面进行一个加氢来去除他的悬挂键以及平衡他的电荷

不需要在界面之间加真空层，但是需要在layer之间的初始距离做调整，也就是改变初始距离算静态能量选择最低能量的gap

您好，我想问一下。首先改变初始距离是用layer details 里面的vacuum来调吗。
其次=。=那个切出来的面，我点adjust hydrogen好像没什么反应==。（这里其实挺疑惑地，因为切出来的是晶面，他还是有属于他的周期性所以旁边的悬挂键好像去除不掉，所以一直在想那个要不要去除）
另外就是build surface  和crystal 有什么区别吗。
最后就是我结构优化时所用的参数和计算性质所用的参数可以不一样吗。谢谢你了-0-
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3楼2017-06-09 15:04:33
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zhangfrank

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
jzjy1994: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2017-06-09 15:38:54
引用回帖:
3楼: Originally posted by jzjy1994 at 2017-06-09 15:04:33
您好，我想问一下。首先改变初始距离是用layer details 里面的vacuum来调吗。
其次=。=那个切出来的面，我点adjust hydrogen好像没什么反应==。（这里其实挺疑惑地，因为切出来的是晶面，他还是有属于他的周期性所 ...

"首先改变初始距离是用layer details 里面的vacuum来调吗。"
》》》不是，是你选中一个表面，自己move

加H是自己手动加，我没有用过adjust H. 我用的是build-add atom输入原子坐标

build surface只是一个表面（只是2d的一个模型，没有真空）。crystal是一个晶体（具有3d的空间对称性了。另外这个晶体可以有真空可以没有真空）

可以不一样 自己酌情选择
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迷Fy
计算顺利点吧
4楼2017-06-09 15:16:00
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jzjy1994

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangfrank at 2017-06-09 15:16:00
"首先改变初始距离是用layer details 里面的vacuum来调吗。"
》》》不是，是你选中一个表面，自己move

加H是自己手动加，我没有用过adjust H. 我用的是build-add atom输入原子坐标

build surface ...

谢谢你了
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5楼2017-06-09 15:39:05
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迷Fy

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangfrank at 2017-06-09 15:16:00
"首先改变初始距离是用layer details 里面的vacuum来调吗。"
》》》不是，是你选中一个表面，自己move

加H是自己手动加，我没有用过adjust H. 我用的是build-add atom输入原子坐标

build ...

我想请问一下，界面的间距怎么设置，您说的在一个表面模型move是什么意思，不太明白，是在切模型时候调整切的位置吗？

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6楼2017-11-06 18:06:11
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