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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » atat 软件安装后运行runstruct_vasp str.out提示找不到势函数
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080908010

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] atat 软件安装后运行runstruct_vasp str.out提示找不到势函数

安装完ATAT之后，在目标目录下执行命令：runstruct_vasp  -nr，提示找不到势函数文件：
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.125000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.250000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.375000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.500000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,1.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/1.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/end/POTCAR.Z: No such file or directory

然后修改~/bin/ezvasp的势函数路径：
原
#!/bin/csh
#enter name of vasp executable here
set VASPCMD="vasp"
#enter the directories containing the pseudopotentials here
set POTLDA="/usr/local/lib/paw_lda"
set POTPBE="/usr/local/lib/paw_pbe"
set POTPAWGGA="/usr/local/lib/paw_pbe"
set POTPAWLDA="/usr/local/lib/paw_lda"
set POTPAWPBE="/usr/local/lib/paw_pbe"

把势函数paw_lda、paw_pbe拷贝到/HOME/psupotential/目录下，然后修改ezvasp中的势函数路径为：
#!/bin/csh
#enter name of vasp executable here
set VASPCMD="vasp"
#enter the directories containing the pseudopotentials here
set POTLDA="/HOME/psupotential/paw_lda"
set POTPBE="/HOME/psupotential/paw_pbe"
set POTPAWGGA="/HOME/psupotential/paw_pbe"
set POTPAWLDA="/HOME/psupotential/paw_lda"
set POTPAWPBE="/HOME/psupotential/paw_pbe"
%%%%保存并执行命令：runstruct_vasp  -nr   
但还是提示找不到势函数文件:
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.125000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.250000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.375000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.500000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,1.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/1.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/end/POTCAR.Z: No such file or directory
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1楼 2017-06-07 10:45:09
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kule150

木虫 (小有名气)
★
080908010(金币+1): 谢谢参与
你的问题解决了吗，我刚解决掉：
好像还需要改一个隐藏文件的路径，输入vi -v ~/.ezvasp.rc，把这个文件中的路径也改掉，还有就是看一下你的赝势库的文件路径，是不是按照这个路径/HOME/psupotential/paw_lda能找到例如Au/POTCAR.z等的文件
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080908010
25楼2017-07-30 14:21:41
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jufayin5楼
2017-06-07 12:17   回复  
080908010(金币+1): 谢谢参与
发自小木虫IOS客户端
wdxmu10楼
2017-06-07 19:17   回复  
080908010(金币+1): 谢谢参与
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yuyuewen14楼
2017-06-09 23:49   回复  
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