应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » atat 软件安装后运行runstruct_vasp str.out提示找不到势函数
51/1返回列表
查看: 3865  |  回复: 34
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

080908010

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] atat 软件安装后运行runstruct_vasp str.out提示找不到势函数

安装完ATAT之后，在目标目录下执行命令：runstruct_vasp  -nr，提示找不到势函数文件：
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.125000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.250000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.375000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.500000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,1.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/1.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/end/POTCAR.Z: No such file or directory

然后修改~/bin/ezvasp的势函数路径：
原
#!/bin/csh
#enter name of vasp executable here
set VASPCMD="vasp"
#enter the directories containing the pseudopotentials here
set POTLDA="/usr/local/lib/paw_lda"
set POTPBE="/usr/local/lib/paw_pbe"
set POTPAWGGA="/usr/local/lib/paw_pbe"
set POTPAWLDA="/usr/local/lib/paw_lda"
set POTPAWPBE="/usr/local/lib/paw_pbe"

把势函数paw_lda、paw_pbe拷贝到/HOME/psupotential/目录下，然后修改ezvasp中的势函数路径为：
#!/bin/csh
#enter name of vasp executable here
set VASPCMD="vasp"
#enter the directories containing the pseudopotentials here
set POTLDA="/HOME/psupotential/paw_lda"
set POTPBE="/HOME/psupotential/paw_pbe"
set POTPAWGGA="/HOME/psupotential/paw_pbe"
set POTPAWLDA="/HOME/psupotential/paw_lda"
set POTPAWPBE="/HOME/psupotential/paw_pbe"
%%%%保存并执行命令：runstruct_vasp  -nr   
但还是提示找不到势函数文件:
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.125000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.250000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.375000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.500000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,1.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/1.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/end/POTCAR.Z: No such file or directory
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

zhukkkkf

» 猜你喜欢

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2017-06-07 10:45:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kule150

木虫 (小有名气)
★
080908010(金币+1): 谢谢参与
你的问题解决了吗，我刚解决掉：
好像还需要改一个隐藏文件的路径，输入vi -v ~/.ezvasp.rc，把这个文件中的路径也改掉，还有就是看一下你的赝势库的文件路径，是不是按照这个路径/HOME/psupotential/paw_lda能找到例如Au/POTCAR.z等的文件
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

080908010
25楼2017-07-30 14:21:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 35 个回答
简单回复
jufayin5楼
2017-06-07 12:17   回复  
080908010(金币+1): 谢谢参与
发自小木虫IOS客户端
wdxmu10楼
2017-06-07 19:17   回复  
080908010(金币+1): 谢谢参与
一 发自小木虫IOS客户端
yuyuewen14楼
2017-06-09 23:49   回复  
080908010(金币+1): 谢谢参与
发自小木虫Android客户端
查看全部 35 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +9 kulium 2026-08-21 10/500 2026-08-21 19:19 by 诗眼倦天涯
[基金申请] 科研孤儿太难了 +16 我4大白菜 2026-08-20 17/850 2026-08-21 19:07 by sakuraai
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +15 医学老男孩 2026-08-20 19/950 2026-08-21 18:54 by 医学老男孩
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 14/700 2026-08-21 16:51 by applepetty
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 人气不行了 +7 fansofjerry 2026-08-21 7/350 2026-08-21 14:13 by Vivilian
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +23 yaoyewhu2008 2026-08-20 25/1250 2026-08-21 12:19 by Poppy1104
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +15 archvillain 2026-08-15 27/1350 2026-08-21 11:32 by tim76
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +15 kkkl_v 2026-08-19 16/800 2026-08-21 11:22 by 365372687
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 13/650 2026-08-21 08:30 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +4 archvillain 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:10 by gatelove
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜？ +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭