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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » atat 软件安装后运行runstruct_vasp str.out提示找不到势函数
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080908010

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] atat 软件安装后运行runstruct_vasp str.out提示找不到势函数

安装完ATAT之后，在目标目录下执行命令：runstruct_vasp  -nr，提示找不到势函数文件：
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.125000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.250000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.375000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.500000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,1.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/1.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/end/POTCAR.Z: No such file or directory

然后修改~/bin/ezvasp的势函数路径：
原
#!/bin/csh
#enter name of vasp executable here
set VASPCMD="vasp"
#enter the directories containing the pseudopotentials here
set POTLDA="/usr/local/lib/paw_lda"
set POTPBE="/usr/local/lib/paw_pbe"
set POTPAWGGA="/usr/local/lib/paw_pbe"
set POTPAWLDA="/usr/local/lib/paw_lda"
set POTPAWPBE="/usr/local/lib/paw_pbe"

把势函数paw_lda、paw_pbe拷贝到/HOME/psupotential/目录下，然后修改ezvasp中的势函数路径为：
#!/bin/csh
#enter name of vasp executable here
set VASPCMD="vasp"
#enter the directories containing the pseudopotentials here
set POTLDA="/HOME/psupotential/paw_lda"
set POTPBE="/HOME/psupotential/paw_pbe"
set POTPAWGGA="/HOME/psupotential/paw_pbe"
set POTPAWLDA="/HOME/psupotential/paw_lda"
set POTPAWPBE="/HOME/psupotential/paw_pbe"
%%%%保存并执行命令：runstruct_vasp  -nr   
但还是提示找不到势函数文件:
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.125000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.250000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.375000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,0.500000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/0.000000,1.000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/1.000000000/POTCAR.Z: No such file or directory
gzip: /usr/local/lib/pot_lda/end/POTCAR.Z: No such file or directory
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1楼 2017-06-07 10:45:09
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cffyau

至尊木虫 (文坛精英)
★
080908010(金币+1): 谢谢参与
帮顶

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20楼2017-06-10 11:19:39
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新虫 (著名写手)
★
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24楼2017-07-21 00:23:32
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kule150

木虫 (小有名气)
★
080908010(金币+1): 谢谢参与
你的问题解决了吗，我刚解决掉：
好像还需要改一个隐藏文件的路径，输入vi -v ~/.ezvasp.rc，把这个文件中的路径也改掉，还有就是看一下你的赝势库的文件路径，是不是按照这个路径/HOME/psupotential/paw_lda能找到例如Au/POTCAR.z等的文件
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080908010
25楼2017-07-30 14:21:41
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080908010

铁杆木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
25楼: Originally posted by kule150 at 2017-07-30 14:21:41
你的问题解决了吗，我刚解决掉：
好像还需要改一个隐藏文件的路径，输入vi -v ~/.ezvasp.rc，把这个文件中的路径也改掉，还有就是看一下你的赝势库的文件路径，是不是按照这个路径/HOME/psupotential/paw_lda能找到 ...

谢谢哦，一直没有解决呢，后来也就用的别人现成的。

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26楼2017-08-01 00:04:46
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barbern

新虫 (初入文坛)
★
080908010(金币+1): 谢谢参与
楼主有没ATAT软件包，求分享，不知道在哪下

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27楼2018-01-17 18:02:52
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狮子神皓

新虫 (初入文坛)
★
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28楼2018-03-16 17:39:56
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烟雨人bigboy

新虫 (初入文坛)
★
080908010(金币+1): 谢谢参与
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30楼2018-05-02 20:48:51
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maoxinxina

银虫 (小有名气)
★
080908010(金币+1): 谢谢参与
哥，您弄明白了吗？
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31楼2019-07-30 11:59:45
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zxyang1115

银虫 (正式写手)
★
080908010(金币+1): 谢谢参与
你好！想请教你ATAT！我的QQ：498507040

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32楼2019-10-05 21:44:36
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zhukkkkf

新虫 (初入文坛)
★
080908010(金币+1): 谢谢参与
送红花一朵
老哥，能分享一下那五个势函数文件吗？非常感谢。邮箱：zdzndx@163.com
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33楼2020-02-29 17:20:05
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huangfuh

新虫 (初入文坛)
★
080908010(金币+1): 谢谢参与
内容已删除
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34楼2022-02-25 09:38:30
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huangfuh

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
25楼: Originally posted by kule150 at 2017-07-30 14:21:41
你的问题解决了吗，我刚解决掉：
好像还需要改一个隐藏文件的路径，输入vi -v ~/.ezvasp.rc，把这个文件中的路径也改掉，还有就是看一下你的赝势库的文件路径，是不是按照这个路径/HOME/psupotential/paw_lda能找到 ...

你好，我都修改了路径以后还是不行，我的元素名称文件夹下的文件是POTCAR，没有.z，请问这个后缀是必须的嘛？
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35楼2022-02-25 18:00:59
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syhorchid2楼
2017-06-07 11:19   回复  
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超级老快3楼
2017-06-07 11:59   回复  
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1065234284楼
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jufayin5楼
2017-06-07 12:17   回复  
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gengxin606楼
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ywcfrt0467楼
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bj20089898楼
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wdxmu10楼
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cppsjq6511楼
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efwqqk7112楼
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ngabv7613楼
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yuyuewen14楼
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发自小木虫Android客户端
jqpfwg6515楼
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假大空21楼
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yaoyao14522楼
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y 发自小木虫IOS客户端
spc0823楼
2017-06-10 11:46   回复  
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wdxmu29楼
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