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CHIP超声破碎条件咨询？
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有人做过MEF 细胞的超声破碎吗?aim to make the average size less than 500bp 但是几次摸索超声条件以后跑胶后的条带仍然不理想，只有一条带且大小在100bp以下，（超声条件25cycle 30s ON 30s OFF）所以想问一下，MEF 细胞超声破碎的大致条件？请高手指教！ 还有想问一下配置的lysis buffer的保存条件以及lysis buffer 里面的protease inhibitors 是不是必须用现加？ 333333333333.jpg  2222222222222222.jpg |
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MulanQahar
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3楼2017-06-16 01:16:33
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2楼2017-06-16 01:14:59
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还有DNA fragment size peak 200bp 左右最佳。还有很重要的一件是就是，lysis buffer 的添加量直接影响sonication result. 所以要找好那个适当的量。最后，在走下一步之前，check 好size, 发自小木虫Android客户端 |
4楼2017-06-16 01:22:19
MulanQahar
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西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2017-06-16 08:05:46
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如果你是要做，chip seq ， 那么在lysis buffer 里不用加protease inhibitor, 因为后面的实验中，解除cross link 后有这个过程。不加 protease inhibitors 的lysis buffer 室温保存。 发自小木虫Android客户端 |
5楼2017-06-16 01:28:29
