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WSW_Alone

木虫 (著名写手)

[求助] 请教分子生态网络分析几个问题以及Cytoscape启动报错的问题已有1人参与

之前的一批高通量数据没有显著差异,想做一下分子生态网络分析看看有没有什么规律。
看了一些文章多用下列网站在线分析 http://129.15.40.240/mena/ 然后再用Cytoscape软件进行可视化。
请使用过该网站分析的大神不吝赐教。

问题如下:
1)提交http://129.15.40.240/mena/ 的数据是OTU信息还是物种信息,是否需要预处理?
2)格式应该怎么调整,我是用Excel另存为tab分隔的txt格式,有几次成功进行下一步,有时候又报错,不知何故?
3)尝试分析了一次OTU信息,结果我10个样点的信息只给出了一个结果,如何获取每个样点的分析结果?
4)Cytoscape v3.5.1启动程序总是报错(如图),想请教应该怎么解决?

如果有其他软件或方法能够做生态网络分析,也请指教,先行谢过!

请教分子生态网络分析几个问题以及Cytoscape启动报错的问题
Cytoscape启动报错.jpg
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處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
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zlxnnx111

新虫 (著名写手)

楼主这个软件会用了吗?

发自小木虫Android客户端
6楼2018-01-17 00:27:04
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