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WSW_Alone木虫 (著名写手)
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请教分子生态网络分析几个问题以及Cytoscape启动报错的问题 已有1人参与
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之前的一批高通量数据没有显著差异，想做一下分子生态网络分析看看有没有什么规律。 看了一些文章多用下列网站在线分析 http://129.15.40.240/mena/ 然后再用Cytoscape软件进行可视化。 请使用过该网站分析的大神不吝赐教。 问题如下： 1）提交http://129.15.40.240/mena/ 的数据是OTU信息还是物种信息，是否需要预处理？ 2）格式应该怎么调整，我是用Excel另存为tab分隔的txt格式，有几次成功进行下一步，有时候又报错，不知何故？ 3）尝试分析了一次OTU信息，结果我10个样点的信息只给出了一个结果，如何获取每个样点的分析结果？ 4）Cytoscape v3.5.1启动程序总是报错（如图），想请教应该怎么解决？ 如果有其他软件或方法能够做生态网络分析，也请指教，先行谢过！  Cytoscape启动报错.jpg |
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