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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 软件使用与操作 » 分子对接
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licailan88

银虫 (正式写手)

[求助] 分子对接 已有1人参与

请问我要做一个药物对洋刀豆脲酶和幽门螺杆菌脲酶的分子对接，Grid格子的大小设置X，Y，Z参数怎么设置？Center Grid Box如何设置？请指教，谢谢！
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1楼 2017-06-03 21:23:05
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ioadong

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
Center Grid Box 通常是设在活性口袋的位置，x,y,z的大小要把活性口袋包住，这两个都不要完全精确的。如果实在拿不准，你就可以把center 设在分子中心，xyz把分子全包围，不过这样会增加计算量。
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licailan88
以科学的理性代替天然的非理性。
2楼2017-06-03 22:32:46
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licailan88

银虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by ioadong at 2017-06-03 22:32:46
Center Grid Box 通常是设在活性口袋的位置，x,y,z的大小要把活性口袋包住，这两个都不要完全精确的。如果实在拿不准，你就可以把center 设在分子中心，xyz把分子全包围，不过这样会增加计算量。

好的，谢谢您！您说的分子中心，是药物分子还是受体分子？

发自小木虫Android客户端
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3楼2017-06-03 23:51:07
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谁家那小孩
顶一下
4楼2017-06-13 14:17:36
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