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toxicLi

新虫 (初入文坛)

[求助] 我想知道怎么建立泛素的pdb文件

我想建立泛素的pdb文件，就是从小分子一点点的弄，可是我没有头绪，请各路高人能不能指点一下迷津。谢谢！

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1楼 2017-05-29 16:29:22
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hclwonder

新虫 (正式写手)
没有这么干的吧。你这是要？

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2楼2017-05-30 13:20:57
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toxicLi

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hclwonder at 2017-05-30 13:20:57
没有这么干的吧。你这是要？

我想看看能不能自己建立泛素的pdb文件，因为我不会用小分子建大分子，所以想知道怎么做

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3楼2017-05-30 14:39:14
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hclwonder

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by toxicLi at 2017-05-30 14:39:14
我想看看能不能自己建立泛素的pdb文件，因为我不会用小分子建大分子，所以想知道怎么做
...

蛋白质的结构大多通过实验测定，也常见同源模建（如果有好的模板），但准确性相对较低。
另有从头预测方法，即通过序列直接预测三维结构，但计算量很大，也还不成熟，只能用于肽或小蛋白，但也不一定准确。

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4楼2017-05-30 15:27:48
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toxicLi

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by hclwonder at 2017-05-30 15:27:48
蛋白质的结构大多通过实验测定，也常见同源模建（如果有好的模板），但准确性相对较低。
另有从头预测方法，即通过序列直接预测三维结构，但计算量很大，也还不成熟，只能用于肽或小蛋白，但也不一定准确。
...

谢谢

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5楼2017-05-31 15:28:37
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onion77

新虫 (小有名气)
可以直接去PDB search Ubiquitin，有好多泛素的结构

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6楼2017-06-02 23:34:42
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toxicLi

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by onion77 at 2017-06-02 23:34:42
可以直接去PDB search Ubiquitin，有好多泛素的结构

我的想法是如果蛋白质库里没有的蛋白结构能不能自己建

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7楼2017-06-04 08:34:15
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