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chen卡神

新虫 (小有名气)

[求助] 如何建立本地的BLAST库,便于比对。有没有小伙伴可以指点一二。

我有细菌的全基因组,想建立一个本地的BLAST库,以便于序列比对,哪位亲可以指点一下?在成都的我可以请你吃饭,不在成都的来成都玩的话,我请你吃饭,拜托拜托。
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逍遥ttm

新虫 (小有名气)

仅供参考:从别人文献上或者ncbi上找10个左右和你的菌是同属不同种的菌的基因,建库比对

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2楼2017-05-29 23:04:43
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chen卡神

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 逍遥ttm at 2017-05-29 23:04:43
仅供参考:从别人文献上或者ncbi上找10个左右和你的菌是同属不同种的菌的基因,建库比对

亲,建进化树是这么干的,我是建一个本地库,然后从NCBI,中找新的东西来比对,看有没有新发现。

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3楼2017-05-30 00:03:34
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chen卡神

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by chen卡神 at 2017-05-30 00:03:34
亲,建进化树是这么干的,我是建一个本地库,然后从NCBI,中找新的东西来比对,看有没有新发现。
...

还是很感谢你

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4楼2017-05-30 00:03:53
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拼品

新虫 (初入文坛)

楼主这个问题解决了吗,我遇到了一模一样的问题,请问你是怎么构建的呢
5楼2017-10-04 21:09:25
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chen卡神

新虫 (小有名气)

我尝试着建了,但是用不了不知道为啥

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6楼2017-10-05 00:56:32
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水浴风情

木虫 (著名写手)

下一个bioedit,然后创建local database,接着就local balst就可以了

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7楼2018-05-28 21:10:48
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水浴风情

木虫 (著名写手)

去年的贴。。。估计楼主都弄好了吧

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8楼2018-05-28 21:12:02
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