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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 如何建立本地的BLAST库，便于比对。有没有小伙伴可以指点一二。
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chen卡神

新虫 (小有名气)

[求助] 如何建立本地的BLAST库，便于比对。有没有小伙伴可以指点一二。

我有细菌的全基因组，想建立一个本地的BLAST库，以便于序列比对，哪位亲可以指点一下？在成都的我可以请你吃饭，不在成都的来成都玩的话，我请你吃饭，拜托拜托。
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1楼 2017-05-29 14:39:04
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逍遥ttm

新虫 (小有名气)
仅供参考：从别人文献上或者ncbi上找10个左右和你的菌是同属不同种的菌的基因，建库比对

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2楼2017-05-29 23:04:43
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chen卡神

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 逍遥ttm at 2017-05-29 23:04:43
仅供参考：从别人文献上或者ncbi上找10个左右和你的菌是同属不同种的菌的基因，建库比对

亲，建进化树是这么干的，我是建一个本地库，然后从NCBI,中找新的东西来比对，看有没有新发现。

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3楼2017-05-30 00:03:34
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chen卡神

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by chen卡神 at 2017-05-30 00:03:34
亲，建进化树是这么干的，我是建一个本地库，然后从NCBI,中找新的东西来比对，看有没有新发现。
...

还是很感谢你

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4楼2017-05-30 00:03:53
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拼品

新虫 (初入文坛)
楼主这个问题解决了吗，我遇到了一模一样的问题，请问你是怎么构建的呢
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5楼2017-10-04 21:09:25
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chen卡神

新虫 (小有名气)
我尝试着建了，但是用不了不知道为啥

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6楼2017-10-05 00:56:32
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水浴风情

木虫 (著名写手)
下一个bioedit，然后创建local database，接着就local balst就可以了

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7楼2018-05-28 21:10:48
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水浴风情

木虫 (著名写手)
去年的贴。。。估计楼主都弄好了吧

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8楼2018-05-28 21:12:02
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