24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 753  |  回复: 10
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

jiawdd

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】DMOL算团簇出现虚频怎么处理

DMOL计算团簇频率时
结果里显示虚频
怎么处理
或者是怎么根据结果修改原结构
或是改动设置
以消除虚频
MS的频率分析有每个频率振动模式的动画,点那个虚频,我基本上所有原子都在震动,看不出相互间的区别
哪位能加下我QQ嘛
403803032
具体的还是操作不了
谢谢
部分结果如下
vibrational frequencies, intensities
  mode     au_amu        cm-1      km/mol
    1   -0.028596      -147.0       24.91
    8    0.008831        45.4        0.83
    9    0.030837       158.5        0.00
   10    0.036730       188.8        0.55
   11    0.038944       200.2        0.00
   12    0.046522       239.1        0.07
   13    0.052664       270.7        7.56
   14    0.054573       280.5        0.21
   15    0.054980       282.6       13.56
   16    0.057609       296.1        1.83
   17    0.059759       307.2        0.77
   18    0.062154       319.5        0.77
   19    0.063421       326.0        2.58
   20    0.065588       337.2        2.37
   21    0.066464       341.7        0.11
   22    0.068265       350.9        0.01
   23    0.069667       358.1        2.42
   24    0.069715       358.4        1.34
   25    0.069872       359.2        3.38
   26    0.070710       363.5        1.09
   27    0.073629       378.5       13.24
   28    0.083566       429.6       23.60
   29    0.087914       451.9        6.32
   30    0.088010       452.4       28.86
   31    0.091347       469.6        3.70
   32    0.093242       479.3       48.56
   33    0.093354       479.9        1.37
   34    0.095147       489.1        0.12
   35    0.095423       490.5       63.75
   36    0.097032       498.8       53.43
   37    0.097325       500.3        2.95
   38    0.102534       527.1        4.26
   39    0.103699       533.1       38.00
   40    0.118767       610.5        0.01
   41    0.119278       613.1       17.32
   42    0.120109       617.4        0.01
   43    0.122503       629.7       38.48
   44    0.126460       650.1       33.02
   45    0.132106       679.1        9.23
   46    0.137807       708.4       52.68
   47    0.139170       715.4       12.45
   48    0.146548       753.3       93.99
   49    0.152750       785.2       58.98
   50    0.164065       843.4       14.53
   51    0.171902       883.7      137.25
   52    0.175035       899.8        3.22
   53    0.175208       900.7        0.09
   54    0.183678       944.2      127.72


  Frequencies (cm-1) and normal modes
        1: -147.0    8:   45.4    9:  158.5   10:  188.8   11:  200.2   12:  239.1   13:  270.7   14:  280.5   15:  282.6
  
Si x      0.0244       0.0021       0.0039       0.0856       0.0023       0.0068      -0.0063       0.0073       0.0939
    y      0.0917      -0.0356      -0.0441       0.0692      -0.0523      -0.0724       0.0852       0.0177      -0.0533
    z      0.1447       0.0217       0.0274       0.1003       0.0295       0.0472      -0.0564      -0.0285      -0.0894
O  x     -0.0252      -0.0214       0.1685       0.0569      -0.0330       0.0509      -0.0776       0.0257       0.0266
    y     -0.0152       0.1252       0.0210       0.0433      -0.0663       0.0545       0.0695      -0.0511      -0.0770
    z      0.0064       0.0226       0.1313      -0.0364       0.0913      -0.0052      -0.0137       0.1199      -0.0204
Si x     -0.0141       0.0412       0.1404      -0.0184      -0.1137      -0.0136      -0.0312      -0.0494      -0.0407
    y     -0.0003      -0.2614       0.0209       0.2079      -0.0224       0.1276       0.1233       0.0204       0.2328
    z     -0.0009      -0.0248       0.0114      -0.1916      -0.0028      -0.0703       0.1499       0.0098       0.1193
O  x     -0.0269      -0.0173       0.1854      -0.0616      -0.0316      -0.0629       0.0547       0.0245      -0.0105
    y      0.0065       0.1260       0.0300       0.0307       0.0525       0.0375       0.0899       0.0343      -0.0918
    z     -0.0111       0.0217      -0.1014      -0.0533      -0.0931      -0.0154      -0.0048      -0.1151       0.0056
Si x      0.0722       0.0039      -0.0034      -0.1168      -0.0008       0.0049      -0.0076      -0.0046      -0.0543
    y     -0.0780      -0.0344       0.0441       0.0424       0.0491      -0.0718       0.0820      -0.0381      -0.0707

[ Last edited by jiawdd on 2009-2-17 at 17:25 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

study163

木虫 (正式写手)

天生我材

★ ★ ★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):xiexie讨论
jiawdd(金币+2,VIP+0):谢谢
很容易搞定,对出现虚频原子的对应的坐标按振动幅度调节,比如你的硅的就可以直接加减在原坐标上
我的计算我做主
8楼2009-01-12 15:06:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

jiawdd

铜虫 (小有名气)

z     -0.1365       0.0206      -0.0274       0.0814      -0.0362       0.0481      -0.0571       0.0042      -0.1078
O  x     -0.0427       0.0611      -0.0590      -0.0077       0.0337       0.0704       0.0945       0.0710       0.0168
2楼2009-01-11 17:28:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

58153365

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):非常感谢
jiawdd(金币+2,VIP+0):谢谢
提高计算精度,将Max.force调小,再优化结构试试
3楼2009-01-11 20:48:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaowandouer

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
fegg7502(金币+3,VIP+0):thanks
jiawdd(金币+3,VIP+0):谢谢
根据vibrational analysis 里面的振动模式调整构型,然后继续优化
我的经验是,这样一般都能把虚频去掉
4楼2009-01-12 08:58:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见