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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】DMOL算团簇出现虚频怎么处理
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jiawdd

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】DMOL算团簇出现虚频怎么处理

DMOL计算团簇频率时
结果里显示虚频
怎么处理
或者是怎么根据结果修改原结构
或是改动设置
以消除虚频
MS的频率分析有每个频率振动模式的动画，点那个虚频，我基本上所有原子都在震动，看不出相互间的区别
哪位能加下我QQ嘛
403803032
具体的还是操作不了
谢谢
部分结果如下
vibrational frequencies, intensities
  mode     au_amu        cm-1      km/mol
    1   -0.028596      -147.0       24.91
    8    0.008831        45.4        0.83
    9    0.030837       158.5        0.00
   10    0.036730       188.8        0.55
   11    0.038944       200.2        0.00
   12    0.046522       239.1        0.07
   13    0.052664       270.7        7.56
   14    0.054573       280.5        0.21
   15    0.054980       282.6       13.56
   16    0.057609       296.1        1.83
   17    0.059759       307.2        0.77
   18    0.062154       319.5        0.77
   19    0.063421       326.0        2.58
   20    0.065588       337.2        2.37
   21    0.066464       341.7        0.11
   22    0.068265       350.9        0.01
   23    0.069667       358.1        2.42
   24    0.069715       358.4        1.34
   25    0.069872       359.2        3.38
   26    0.070710       363.5        1.09
   27    0.073629       378.5       13.24
   28    0.083566       429.6       23.60
   29    0.087914       451.9        6.32
   30    0.088010       452.4       28.86
   31    0.091347       469.6        3.70
   32    0.093242       479.3       48.56
   33    0.093354       479.9        1.37
   34    0.095147       489.1        0.12
   35    0.095423       490.5       63.75
   36    0.097032       498.8       53.43
   37    0.097325       500.3        2.95
   38    0.102534       527.1        4.26
   39    0.103699       533.1       38.00
   40    0.118767       610.5        0.01
   41    0.119278       613.1       17.32
   42    0.120109       617.4        0.01
   43    0.122503       629.7       38.48
   44    0.126460       650.1       33.02
   45    0.132106       679.1        9.23
   46    0.137807       708.4       52.68
   47    0.139170       715.4       12.45
   48    0.146548       753.3       93.99
   49    0.152750       785.2       58.98
   50    0.164065       843.4       14.53
   51    0.171902       883.7      137.25
   52    0.175035       899.8        3.22
   53    0.175208       900.7        0.09
   54    0.183678       944.2      127.72


  Frequencies (cm-1) and normal modes
        1: -147.0    8:   45.4    9:  158.5   10:  188.8   11:  200.2   12:  239.1   13:  270.7   14:  280.5   15:  282.6
  
Si x      0.0244       0.0021       0.0039       0.0856       0.0023       0.0068      -0.0063       0.0073       0.0939
    y      0.0917      -0.0356      -0.0441       0.0692      -0.0523      -0.0724       0.0852       0.0177      -0.0533
    z      0.1447       0.0217       0.0274       0.1003       0.0295       0.0472      -0.0564      -0.0285      -0.0894
O  x     -0.0252      -0.0214       0.1685       0.0569      -0.0330       0.0509      -0.0776       0.0257       0.0266
    y     -0.0152       0.1252       0.0210       0.0433      -0.0663       0.0545       0.0695      -0.0511      -0.0770
    z      0.0064       0.0226       0.1313      -0.0364       0.0913      -0.0052      -0.0137       0.1199      -0.0204
Si x     -0.0141       0.0412       0.1404      -0.0184      -0.1137      -0.0136      -0.0312      -0.0494      -0.0407
    y     -0.0003      -0.2614       0.0209       0.2079      -0.0224       0.1276       0.1233       0.0204       0.2328
    z     -0.0009      -0.0248       0.0114      -0.1916      -0.0028      -0.0703       0.1499       0.0098       0.1193
O  x     -0.0269      -0.0173       0.1854      -0.0616      -0.0316      -0.0629       0.0547       0.0245      -0.0105
    y      0.0065       0.1260       0.0300       0.0307       0.0525       0.0375       0.0899       0.0343      -0.0918
    z     -0.0111       0.0217      -0.1014      -0.0533      -0.0931      -0.0154      -0.0048      -0.1151       0.0056
Si x      0.0722       0.0039      -0.0034      -0.1168      -0.0008       0.0049      -0.0076      -0.0046      -0.0543
    y     -0.0780      -0.0344       0.0441       0.0424       0.0491      -0.0718       0.0820      -0.0381      -0.0707

[ Last edited by jiawdd on 2009-2-17 at 17:25 ]
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1楼2009-01-11 17:25:52
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jiawdd

铜虫 (小有名气)
z     -0.1365       0.0206      -0.0274       0.0814      -0.0362       0.0481      -0.0571       0.0042      -0.1078
O  x     -0.0427       0.0611      -0.0590      -0.0077       0.0337       0.0704       0.0945       0.0710       0.0168
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2楼2009-01-11 17:28:53
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58153365

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):非常感谢
jiawdd(金币+2,VIP+0):谢谢
提高计算精度，将Max.force调小，再优化结构试试
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3楼2009-01-11 20:48:26
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xiaowandouer

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
fegg7502(金币+3,VIP+0):thanks
jiawdd(金币+3,VIP+0):谢谢
根据vibrational analysis 里面的振动模式调整构型，然后继续优化
我的经验是，这样一般都能把虚频去掉
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4楼2009-01-12 08:58:21
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jiawdd

铜虫 (小有名气)
楼上
能不能具体点讲怎么做
可以举个例子
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5楼2009-01-12 14:07:52
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jiawdd

铜虫 (小有名气)
Frequency (1/cm)          Intensity (km/mol)
-147.00000000        24.91000000
45.40000000        0.83000000
158.52000000        0.00000000
188.81000000        0.55000000
200.20000000        0.00000000
239.15000000        0.07000000
270.72000000        7.56000000
280.54000000        0.21000000
282.63000000        13.56000000
296.14000000        1.83000000
307.20000000        0.77000000
319.51000000        0.77000000
326.02000000        2.58000000
337.16000000        2.37000000
341.67000000        0.11000000
350.92000000        0.01000000
358.13000000        2.42000000
358.38000000        1.34000000
359.19000000        3.38000000
363.49000000        1.09000000
378.50000000        13.24000000
429.58000000        23.60000000
451.93000000        6.32000000
452.42000000        28.86000000
469.58000000        3.70000000
479.32000000        48.56000000
479.90000000        1.37000000
489.11000000        0.12000000
490.53000000        63.75000000
498.80000000        53.44000000
500.31000000        2.95000000
527.09000000        4.26000000
533.07000000        38.00000000
610.54000000        0.01000000
613.16000000        17.32000000
617.43000000        0.01000000
629.74000000        38.49000000
650.08000000        33.02000000
679.11000000        9.23000000
708.41000000        52.68000000
715.42000000        12.46000000
753.34000000        94.00000000
785.23000000        58.98000000
843.39000000        14.53000000
883.68000000        137.25000000
899.78000000        3.22000000
900.67000000        0.09000000
944.21000000        127.72000000
这是一个(SiO2)6团簇vibrational analysis 的结果
帮忙给看下怎么处理
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6楼2009-01-12 14:37:18
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
★ ★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):xiexie讨论
jiawdd(金币+1,VIP+0):谢谢
1 提高精度， 2  就是看看虚频对应哪个原子振动，然后对该原子位置做稍许的移动，一般可以消除。
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7楼2009-01-12 14:45:47
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study163

木虫 (正式写手)

天生我材
★ ★ ★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):xiexie讨论
jiawdd(金币+2,VIP+0):谢谢
很容易搞定，对出现虚频原子的对应的坐标按振动幅度调节，比如你的硅的就可以直接加减在原坐标上
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我的计算我做主
8楼2009-01-12 15:06:44
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jiawdd

铜虫 (小有名气)
对应原子怎么找到啊
还有怎么加上去啊？
我有个数据在1楼呢
帮忙看看

[ Last edited by jiawdd on 2009-1-12 at 15:57 ]
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9楼2009-01-12 15:54:27
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励交流！
jiawdd(金币+2,VIP+0):谢谢
MS的频率分析有每个频率振动模式的动画啊，点那个虚频，看看是哪个原子震动不就知道么
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10楼2009-01-12 21:53:12
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