| 查看: 6503 | 回复: 48 | ||||||
| 【奖励】 本帖被评价22次，作者ilpisces增加金币 17 个 | ||||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||||
[资源]
用Gnuplot画出分子轨道
|
||||||
|
理论化学专业的学生经常需要解析分子轨道(MO),而常用的量子化学程序(比如Gaussian,Gamess,ADF 等),通常配有相应的应用程序将分子轨道可视化。其实,借用绘图软件(比如 Gnuplot)和一些脚本代码,自己动手也可画出分子轨道。而这一过程对于理解量子化学一些基本概念,比如原子轨道(AO),基组,分子轨道等,不失为一个好的训练方法。本文中例在Gnuplot 4.6版本运行。 [ Last edited by ilpisces on 2017-5-25 at 10:19 ] |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 用Gnuplot画出分子轨道.pdf
2017-05-24 08:45:28, 1.38 M
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 粒子宇宙生命 | 第一性原理杂 | 量子化学和计算化学 | Photonic Crystal |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
» 猜你喜欢
七嗪类物质合成求助
已经有0人回复
-
软包
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有221人回复
-
软包电池的N/P是多少合适
已经有0人回复
-
招贤纳博（已结束）
已经有28人回复
-
表征测试机构后台私聊我
已经有0人回复
-
Coordination Chemistry Reviews
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
2楼2017-05-24 09:53:41
4楼2017-05-24 10:13:53
|
谢谢！slater型波函数以及在SCF中得到的轨道与类氢离子波函数只是有效核电荷数Z不同，可以这样理解吗？用变分法确定那个Z。昨天把Gauss型分子积分又看了一遍，用几个Gauss型函数拟合一个slater函数，在分子自洽场计算过程中，组合系数和gauss函数的轨道系数都要优化吗？还是在做分子自洽场计算前已经优化好了？ 发自小木虫Android客户端 |
13楼2017-05-26 16:33:51
16楼2017-05-26 20:04:46
|
看了，您写的内容很丰富，我还要仔细的读一读。不同的人看同一本书体会也不一样。可能是我刚入门不久，很多东西理解不准确，还请老师多多指导。（毕竟这是量子化学，专业性很强的东西，不像小说一遍就能明白） 发自小木虫Android客户端 |
17楼2017-05-26 20:08:30
|
独立粒子近似下，原子自洽场和分子自洽场的解是类似的吧？只是原子中单粒子对应的平均势场是中心对称的，而分子中单电子对应的平均势场符合分子点群的对称性。分子轨道，分子的电子组态按其所属点群的不可约表示，能级依次排列增加 发自小木虫Android客户端 |
20楼2017-05-26 21:22:47
|
量化书上说，分子自洽场继承了原子自洽场，对原子自洽场讨论得到的结论，在分子自洽场中同样适用。这里面分子关于无扰态，谱项，谱项波函数与原子中相关概念（除了少许变动）几乎一样。 还有个问题，分子轨道是分子点群不可约表示的基，点群不可约表示最多是三维，所以分子轨道最多三重简并，不存在更高的简并度，这样的判断对吗？ 发自小木虫Android客户端 |
23楼2017-05-26 23:42:38
|
您的文章说的是如何根据基组和分子轨道系数画出分子轨道图。我可以这么理解吗？ 主要是我最近在学自洽场，而且分子自洽场这部分书上写的很简略，很难看懂；如果您详细讲解，并配上几个不同点群分子的例子，我觉得非常有意义，可以知道来龙去脉，毕竟化学生经常把软件当黑箱。 不过那样的话，估计工作量会很大。即便不可，也希望您在有空的时候能够给予指导 发自小木虫Android客户端 |
24楼2017-05-27 00:23:02
28楼2017-05-27 10:16:51
送红花一朵|
是的，从理论到程序有很大的鸿沟，感谢您的贡献和答疑。 如果我想学习Gnuplot, 看懂您的代码，应该如何入手呢？ 主要编程这方面我完全空白，但大致意思我能明白，就是知道了函数的解析式，然后取值，在坐标系上找点画图，当然程序实现起来一定不这么简单。 您用CO为例，画出分子轨道的图形，我可以就这一点请教您一下么？ C和O共有10个原子轨道，每个原子轨道用3个GTO来拟合，每一个分子轨道都是这10个原子轨道的线性组合（当然有些时候系数为0），每个组合系数对3个GTO(收缩系数)都起作用？那这些组合系数是怎么确定的？ 为什么是Pi成键轨道向pi反键轨道跃迁，而不是sigma2, HOMO轨道向上跃迁？ |
29楼2017-05-27 11:31:05