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itthl

新虫 (小有名气)

[求助] MS软件怎么模拟两个高分子之间的氢键? 已有1人参与

我是用AC模块构建无定型细胞,然后使用forcite模块进行结构优化和动力学,最后算出体系的总能量,然后扣除其中的一个分子,计算剩余体系的能量,用体系的总能量-两个分子单独的能量,是否是两分子间的氢键?算出来能量差数值是-123左右,说明是氢键吗?另一个结构的算出来是正的一百多?不知道怎么分析,求教大神相助,不胜感激!!!!
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yuzhiboban

新虫 (初入文坛)

你这样就默认了两个分子之间只有氢键作用,而且忽略了其他分子对它的作用。

发自小木虫IOS客户端
4楼2017-09-28 12:30:33
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

你这么做的依据呢?
2楼2017-05-23 15:48:39
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mmwan0202

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我个人觉得这个取决于力场,如果力场中分子间相互作用力和分子内相互作用力仅差氢键作用,那么你这么做就是可行的,否则就不能这样算。

发自小木虫Android客户端
3楼2017-05-23 17:43:24
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