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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS软件怎么模拟两个高分子之间的氢键？
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itthl

新虫 (小有名气)

[求助] MS软件怎么模拟两个高分子之间的氢键？ 已有1人参与

我是用AC模块构建无定型细胞，然后使用forcite模块进行结构优化和动力学，最后算出体系的总能量，然后扣除其中的一个分子，计算剩余体系的能量，用体系的总能量-两个分子单独的能量，是否是两分子间的氢键？算出来能量差数值是-123左右，说明是氢键吗？另一个结构的算出来是正的一百多？不知道怎么分析，求教大神相助，不胜感激！！！！
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1楼 2017-05-23 15:04:49
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
你这么做的依据呢？
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2楼2017-05-23 15:48:39
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mmwan0202

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我个人觉得这个取决于力场，如果力场中分子间相互作用力和分子内相互作用力仅差氢键作用，那么你这么做就是可行的，否则就不能这样算。

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3楼2017-05-23 17:43:24
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yuzhiboban

新虫 (初入文坛)
你这样就默认了两个分子之间只有氢键作用，而且忽略了其他分子对它的作用。

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4楼2017-09-28 12:30:33
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Dr_Jesse

铁杆木虫 (著名写手)

沧海一粟，浩宇星尘
三楼正解
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除了你自己，没有人能够阻挡你！
5楼2017-09-28 14:46:21
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