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银虫 (正式写手)

[求助] 大肠杆菌表达的蛋白分子量偏小，但是仍有活性，是何故？

各位同行，在大肠杆菌中表达的蛋白比理论分子量小很多，是降解了吗？但是蛋白仍然具有活性。
我在37℃诱导表达的，在裂解细胞时加了蛋白酶抑制剂cocktail。
有没有什么软件可以分析蛋白序列中潜在的大肠杆菌蛋白酶的识别位点？我想把这些位点突变掉，看看能不能解决这个问题。 @youlinglyw

1楼 2017-05-21 10:13:59

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新虫 (小有名气)

不一定降解了。
其他的情况，氨基酸组成也会影响蛋白大小，因为每个氨基酸不是一样大的。
另氨基酸组成影响了电荷，sds跑胶是一个电荷牵引过程吧，某些氨基酸的组成导致了牵引率改变了

2楼2017-05-22 09:38:43

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银虫 (正式写手)

引用回帖:

2楼: Originally posted by 掌控恶魔 at 2017-05-22 09:38:43
不一定降解了。
其他的情况，氨基酸组成也会影响蛋白大小，因为每个氨基酸不是一样大的。
另氨基酸组成影响了电荷，sds跑胶是一个电荷牵引过程吧，某些氨基酸的组成导致了牵引率改变了

谢谢！理论分子量应为50千道尔顿，实际只有23千道尔顿左右。

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3楼2017-05-22 10:37:51

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银虫 (正式写手)

纯化后得到的也是23 @youlinglyw

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4楼2017-05-22 10:38:27

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