[交流] 请问什么程序语言读取数据文档比较快？ 已有3人参与

2楼: Originally posted by jluchemlib at 2017-05-12 08:29:47
我一般是用lammps输出dcd格式的文件，然后用fortran读取和分析。或者用lammps输出xtc格式的，然后用gromacs里的分析工具进行分析（如果你想计算的性质在gromacs里面有的话）

3楼: Originally posted by 1172756222 at 2017-05-13 11:18:45
感谢您的回复！

试了下用VMD读取dcd格式，速度的确比lammpstrj格式快的多。
matlab中也有fread等函数可用于读取二进制文档。
简单查了一下，dcd是一种单精度的二进制Fortran文档。

对于lammpstrj文档 ...

4楼: Originally posted by jluchemlib at 2017-05-13 13:11:57
dcd因为是二进制的，所以无法直接打开，一般只包括体系box的大小和粒子的坐标，用fortran读取的话，可以参考这个网页，http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/wiki/index.cgi?ReadingDCDinFortran...

7楼: Originally posted by 1172756222 at 2017-05-13 20:00:32
找到了matlab读取dcd的程序包http://www.ks.uiuc.edu/Development/MDTools/matdcd/...