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菠萝吹雪35

铁虫 (初入文坛)

[求助] 如何获得细菌基因组中的抗生素抗性基因相关信息已有2人参与

万能的虫友们,有谁能够指教一下。我知道一个菌的基因组序列,有什么数据库或者什么方法可以查找到有关该菌的基因组抗生素抗性基因的信息。比如含有哪几类,分别是用于编码什么蛋白什么抗生素的。跪求!
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nanhu1984

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
下载抗生素抗性基因数据库,然后用本地blast将你的基因组蛋白质编码基因比对这个数据库,然后解析blastp结果即可
https://www.microbialgenomic.cn/
4楼2017-05-12 16:43:58
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