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向日葵和梦缘

新虫 (初入文坛)

[求助] Red大肠杆菌基因敲除卡那霉素筛选问题 已有1人参与

开始做Red系统的E. coli基因敲除,电转后涂布卡那霉素平板(100ug/ml)没有菌落长出来。不知道是不是抗生素浓度太大的问题。
1、第一次电转PCR片段成功后,卡那霉素平板(50ug/ml)上长出了单菌落,随后又出现了很多小菌落,以为是抗生素浓度低未抑制。
2、随后又做了好几次感受态做电转,电转后涂布卡那霉素平板(100ug/ml)都没有菌落长出来。
  请教大神高手,不胜感激。
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junior850621

铁杆木虫 (著名写手)

还是五十吧,一百略高。或者试一下中间值?

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2楼2017-05-05 20:34:09
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向日葵和梦缘

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by junior850621 at 2017-05-05 20:34:09
还是五十吧,一百略高。或者试一下中间值?

你做过这方面的敲除吗,感受态制作你加诱导剂诱导多长时间

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3楼2017-05-06 08:06:19
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我们做的时候卡纳霉素浓度是30,筛选没有问题,估计是你转化的问题,目的片段没有导进去或者导进去之后没有发生同源重组,也可能是感受态做的问题,red系统表达量不够

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···
4楼2017-05-06 11:53:12
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向日葵和梦缘

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小冀- at 2017-05-06 11:53:12
我们做的时候卡纳霉素浓度是30,筛选没有问题,估计是你转化的问题,目的片段没有导进去或者导进去之后没有发生同源重组,也可能是感受态做的问题,red系统表达量不够

那你感受态制作的诱导剂的加入时间和浓度分别是多少呀,

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5楼2017-05-06 15:36:44
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

引用回帖:
5楼: Originally posted by 向日葵和梦缘 at 2017-05-06 15:36:44
那你感受态制作的诱导剂的加入时间和浓度分别是多少呀,
...

我用的质粒是pkd46,诱导剂就是阿拉伯糖,终浓度30mM,接种时直接加进去,大概诱导两个多小时至OD到0.4

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···
6楼2017-05-07 09:37:07
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张凡云

至尊木虫 (职业作家)

应该是感受态制备的问题,阿拉伯糖要新鲜配置,因为这个的存储期短,容易变构,其实用最新的crispr cas系统做大肠杆菌的敲除,效率更高,个人看法而已

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7楼2017-05-07 11:50:57
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向日葵和梦缘

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 张凡云 at 2017-05-07 11:50:57
应该是感受态制备的问题,阿拉伯糖要新鲜配置,因为这个的存储期短,容易变构,其实用最新的crispr cas系统做大肠杆菌的敲除,效率更高,个人看法而已

哦,原来阿拉伯糖要现配现用呀,谢谢!我尝试一下!

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8楼2017-05-07 16:14:09
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向日葵和梦缘

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 小冀- at 2017-05-07 09:37:07
我用的质粒是pkd46,诱导剂就是阿拉伯糖,终浓度30mM,接种时直接加进去,大概诱导两个多小时至OD到0.4...

接种时就加进去阿拉伯糖呀,我都是OD为0.1时加阿拉伯糖,在诱导至OD为0.3,应该是诱导的问题,谢谢啦

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9楼2017-05-07 16:17:38
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