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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 已知引物如何知道它的条件呀！
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西城_墨

金虫 (小有名气)

[求助] 已知引物如何知道它的条件呀！ 已有4人参与

从论文中找到引物但是没有条件，怎么知道这个引物相应的条件呀！引物是
FDNE
5-GGGAATTCCATATGTTGAAACACGTCGCCGCTGCC-3
RDXE 5-
CGGAATTCCTCGAGCTGCCCGGCGCAGCTGTCGTCCTTG-3

@hc-material @gyesang 发自小木虫Android客户端
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1楼 2017-05-03 20:13:41
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
啥条件？不就是Tm值吗？有可能找师兄。
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2楼2017-05-03 21:17:53
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有很多在线或线下引物分析软件，随便选一个用即可
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植物生理群69993869，为避免广告，申请加入请提供木虫昵称，院校及专业信息
3楼2017-05-03 23:24:01
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西城_墨

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2017-05-03 21:17:53
啥条件？不就是Tm值吗？有可能找师兄。

就是tm值！用做PCR的条件！不知道用什么方式能找！

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4楼2017-05-04 11:03:40
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西城_墨

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by starseacow at 2017-05-03 23:24:01
有很多在线或线下引物分析软件，随便选一个用即可

用过premier 5.0没弄出来！能不能请你帮我弄一下！

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5楼2017-05-04 11:05:11
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 西城_墨 at 2017-05-04 11:03:40
就是tm值！用做PCR的条件！不知道用什么方式能找！
...

Tm = 71.6
Tm = 78.4
一定有几个碱基是模板上没有的，实际Tm较低。
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6楼2017-05-04 11:11:00
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西城_墨

金虫 (小有名气)
非常感谢，两个引物的共同条件是取平均值吗？要做PCR的话，软件上面有没有PCR的循环条件呀！比如多少度变性多少时间！软件上能够查到吗！ @starseacow

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7楼2017-05-04 11:24:45
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张小杰ZH


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8楼2017-05-04 11:44:49
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Real000Lee

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
PCR反应体系及条件通常在你买taq酶的说明书上是有的，因为他要介绍酶的最适工作参数
给你个参考，我们用的95度变性，你那个Tm是退火，72度延伸（1000—2000bp/min），4度保存，30~35个循环
根据我的经验通常退火温度低一点容易扩出条带但特异性偏低，高的话正好相反，大批量实验前最好先做个梯度摸清条件
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

西城_墨
9楼2017-05-06 11:23:40
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西城_墨

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by Real000Lee at 2017-05-06 11:23:40
PCR反应体系及条件通常在你买taq酶的说明书上是有的，因为他要介绍酶的最适工作参数
给你个参考，我们用的95度变性，你那个Tm是退火，72度延伸（1000—2000bp/min），4度保存，30~35个循环
根据我的经验通常退火温 ...

非常感谢！！

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10楼2017-05-08 13:50:49
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