24小时热门版块排行榜    

查看: 720  |  回复: 6
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lgsky

铜虫 (初入文坛)

[交流] DNA 提取

我是学环境的,最近导师让我从活性污泥中分离细菌,现在细菌分离出来几百个,但是不知道哪个是,只是从微生物形态学的角度对细菌大概区分了一下,现在还是剩下几十中,不能确定是那个是我们要的菌种,想通过提取dna的方法,经过pcr扩增,连接转化以后送去测序,但是在提取dna的过程中出现了问题,在用Tris饱和酚抽提的时候,混合后呈现粉红色,我加入过量的Tris饱和酚后,提取液也分成,出现红紫色上清液(不知道能不能这么叫),我做了一些对比实验,只有培养液与Tris饱和酚反映出现这种问题,其余试剂都没有出现这种现象。我初步我用来培养细菌的液体培养基里边还有的硫酸亚铁,经过灭菌以后,出现了三价铁(个人初步推算是,没有具体研究,因为液体培养基底部出现红褐色沉淀),随后我又用土壤用同样的方法提取了一遍dna,在跑电泳过程中,出现亮带,说明我试剂和药品没有问题,可能是培养基和酚发生反映。
现在我的问题有这么几个
1.培养基中的三价铁怎么去除,再去除的时候又不损害dna,
2.另外酸碱损害dna,有没有什么限度?比如加多少量,或者是在提取的时候先加NaOH还是在将细菌的细胞膜破裂以后再加,哪个效果好一点,我现在想用NaOH去除三价铁
3. 我怎么检验溶液中是否用三价铁
4.怎么能让硫酸亚铁在灭菌过程中尽可能少的出现三价铁(加酸?保证PH小??

5. 细菌分离过程中,划线一般用什么工具,用接种环还是接种针?还是其他的什么东西
6. 在配置固体培养基的过程中,固体培养基老是呈现出半固体状态,就是30g/L的琼脂粉还是半固态,书上说一般是20g/L就可以了啊,配固体培养基应注意的主要事项都有什么
7.菌种的鉴别,常规的微生物检测的指标应该检验哪几项?
8. 以柠檬酸铁按为主要碳源的微生物,是不是他的体内也应该还有铁?强行离心或者是加NaOH再离心的话,会不会将细菌也离心出来了啊,这个是我比较关心的问题啊

问题就先这么多了啊,主要以前学的太少了啊,不太懂啊
稍后我把我用的方法附上,供大家参考
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lgsky

铜虫 (初入文坛)

估计培养基的最适PH是多少。我从PH6-PH7-PH8分别做了梯度,还是不好用
3楼2009-01-06 14:03:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

xiaofan66

固体培养基的PH值不对,会出现不凝固的现象。
2楼2009-01-06 13:55:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小木虫8580

金虫 (小有名气)

直接用试剂盒提取好了,不要用传统的方法,现在试剂盒又不贵的。

不过你纯培养的DNA应该很容易提才对啊

一般纯培养的菌都是直接沸水浴一下就可以的吧
4楼2009-01-06 15:32:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangzhiyun

铜虫 (初入文坛)

酚变粉红,我第一个就想到肯定是你的酚被氧化了
5楼2009-01-08 10:40:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 336材料求调剂 +5 陈滢莹 2026-03-26 7/350 2026-03-26 23:18 by 不吃魚的貓
[考研] 324求调剂 +5 hanamiko 2026-03-26 6/300 2026-03-26 22:47 by fmesaito
[考研] 333求调剂 +7 87639 2026-03-21 12/600 2026-03-26 22:08 by 不吃魚的貓
[考研] 085701环境工程,267求调剂 +4 minht 2026-03-26 4/200 2026-03-26 20:14 by barlinike
[考研] 07化学280分求调剂 +8 722865 2026-03-23 8/400 2026-03-26 20:00 by 不吃魚的貓
[考研] 085602化学工程求调剂。 +4 平乐乐乐 2026-03-26 4/200 2026-03-26 17:57 by fmesaito
[考研] 22 350 本科985求调剂,求老登收留 +4 李轶男003 2026-03-20 4/200 2026-03-26 16:05 by 哇啦啦啦xtj
[考研] 寻找调剂 +5 倔强芒? 2026-03-21 8/400 2026-03-26 13:25 by 0906ljy
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-25 4/200 2026-03-25 21:26 by 星空星月
[考研] 生物技术与工程 +3 1294608413 2026-03-25 4/200 2026-03-25 18:02 by 1294608413
[考研] 一志愿武理085500机械专业总分300求调剂 +3 an10101 2026-03-24 7/350 2026-03-25 00:00 by 山鬼0-
[考研] 材料292调剂 +8 橘颂思美人 2026-03-23 8/400 2026-03-24 16:33 by laoshidan
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-21 6/300 2026-03-24 15:03 by 余意卿
[考研] 276求调剂。有半年电池和半年高分子实习经历 +9 材料学257求调剂 2026-03-23 10/500 2026-03-24 07:36 by wangy0907
[考研] 284求调剂 +3 yanzhixue111 2026-03-23 6/300 2026-03-23 22:58 by pswait
[考研] 333求调剂 +3 ALULU4408 2026-03-23 3/150 2026-03-23 19:04 by macy2011
[考研] 336化工调剂 +4 王大坦1 2026-03-23 5/250 2026-03-23 18:32 by allen-yin
[考研] 311求调剂 +3 26研0 2026-03-20 3/150 2026-03-22 14:46 by ColorlessPI
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 261求B区调剂,科研经历丰富 +3 牛奶很忙 2026-03-20 4/200 2026-03-20 19:34 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见