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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » Vina 下金属配合物分子对接，原子不识别
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ZRAN

新虫 (小有名气)

[求助] Vina 下金属配合物分子对接，原子不识别 已有1人参与

做一个含金配合物和蛋白的对接，运行后出现错误：ATOM syntax incorrect: "Au" is not a valid AutoDock type.
Note that AutoDock atom types are case-sensitive. 所用金配合物来源于CCDC数据库cifwen文件。已处理2天无任何改变，有没有遇到过这方面问题的，
恳请帮忙，在此谢过
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1楼 2017-04-27 21:10:29
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
ZRAN: 金币+20, ★有帮助 2017-05-05 14:02:33
增加金属原子参数即可
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3楼2017-05-03 08:00:53
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mddock

新虫 (小有名气)
我只知道DS对接没问题，希望对你有帮助

发自小木虫Android客户端
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2楼2017-04-27 22:10:50
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ZRAN

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by longdlut at 2017-05-03 08:00:53
增加金属原子参数即可

金属的参数已经增加，金属电荷为0. 该如何处理呢

发自小木虫IOS客户端
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4楼2017-05-05 14:04:39
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Zlove9325

新虫 (初入文坛)
请问楼主解决这个问题了吗？？
赞一下 回复此楼
5楼2018-08-21 15:29:47
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