应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 高通量测序固氮细菌nifH的OTU相对丰度中unclassified的比例很高
61/1返回列表
查看: 3905  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chenhuan_11

新虫 (小有名气)

[求助] 高通量测序固氮细菌nifH的OTU相对丰度中unclassified的比例很高 已有2人参与

刚刚开始接触土壤分子微生物，最近测出结果很奇怪，如题，OTU中unclassified相对丰度很高，50%~60%，有没有大牛指导一下可能是什么环节出了问题，是所有sample都是这样的结果，不是一个两个。@天使托
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2017-04-27 17:10:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lihua209

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
2楼2017-05-08 16:18:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenhuan_11

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lihua209 at 2017-05-08 16:18:11
你好，最近我的实验也出现了这个问题，请问您的问题解决了吗？

还没有～～～都没有人回复

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2017-05-09 22:27:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

二十一业

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

土壤中的生物成分包括动物、植物、微生物，提取的总DNA中有植物成分的、动物成份的、真菌、细菌、寄生虫等等。你跟公司说的是固氮细菌，所以比对数据库就主要关注细菌的，别的就是unclassified。动植物成分占了这么大的比例当然很正常。
赞一下 回复此楼
4楼2017-05-10 10:26:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenhuan_11

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 二十一业 at 2017-05-10 10:26:14
土壤中的生物成分包括动物、植物、微生物，提取的总DNA中有植物成分的、动物成份的、真菌、细菌、寄生虫等等。你跟公司说的是固氮细菌，所以比对数据库就主要关注细菌的，别的就是unclassified。动植物成分占了这么 ...

意思是很大比例是非细菌组的？可是我看其他相关文献的数据，unclassified的相对风度都很低很低的

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
5楼2017-05-11 20:37:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenxing1991

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你是用的什么引物测的，如果是功能基因的话，我觉得是正常的，如果是16S的话，数据可能就有问题了。
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2018-03-14 09:15:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chenhuan_11 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 C79jjtjAKjEn 2026-09-15 3/150 2026-09-18 03:40 by cITaGg3p5edr
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-18 01:40 by cITaGg3p5edr
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-18 00:28 by cITaGg3p5edr
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-17 22:29 by cuPZTDXS3VOd
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 4/200 2026-09-17 14:27 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 23jxep3nCNZb 2026-09-14 3/150 2026-09-17 13:39 by ObVzqQQh1rrE
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 23jxep3nCNZb 2026-09-14 5/250 2026-09-17 13:29 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 6/300 2026-09-17 12:29 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 mibUvS8DDCwf 2026-09-15 4/200 2026-09-17 06:26 by k06BKNblrGRH
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-17 03:16 by Tql5LQhh5rLK
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-17 02:14 by Tql5LQhh5rLK
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 7/350 2026-09-17 02:14 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 8/400 2026-09-17 01:16 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 23jxep3nCNZb 2026-09-14 4/200 2026-09-16 21:03 by MHf40yA0Uhyb
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-16 14:27 by i3KBRD19ERkG
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 5/250 2026-09-16 02:50 by DgNGHc3h5tPl
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 8/400 2026-09-16 02:23 by DgNGHc3h5tPl
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:14 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-15 07:46 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 4/200 2026-09-14 16:13 by Aj1rhIDL5ixY
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭