应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 计算子扩散系数时，分子只在固定圆环内振动
51/1返回列表
查看: 959  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

流火七月

新虫 (小有名气)

[交流] 计算子扩散系数时，分子只在固定圆环内振动 已有1人参与

参考@pigrass的http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7330890&fpage=1&target=blank，尝试进行了NO在MOR中子扩散系数的模拟
不同之处是forcefield选择的是universal,全硅状态下正常
但是当分子筛内引入了其他金属原子（AL,CU等）后，MD的结果就显示气体分子只在原先location的圆环区域内振动，跑不出那个原本区域，请问这有什么方法可以解决吗？
MD运行时初始速度的设定只有random和current，能不能自己设置一个初始速度呢？
请问@pigrass，可否解答一下？
回复此楼

» 本帖@通知

@pigrass

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2017-04-26 10:22:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

流火七月

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2017-04-29 08:54:58
分子在MD的过程中没有途径整个分子筛，算出来的扩散系数就不对
——没听过这个说法

4000ps时间感觉有点长，不知道是不是你的结构比较特殊所以要这么长
我看到的一般分子筛是时长在200ps，取当中接近直线的一段 ...

是这样的，之前看到过关于扩散机理的一个说法 说的是氧气在pp内不断运动，大部分情况下运动振幅较小，视为振动，偶尔出现一次大的跃迁，氧分子会跳到另外一个区域继续进行小幅度的振动
所以我理解的是，没有跳出原本location的区域，是因为它没有一个更大的速度或者是通道使其进行跃迁，从而进入分子筛的其他区域，因而我觉得这样算出来的扩散系数过于片面

此外，还想请教一下，对于不同的MSD曲线，截取当中接近直线的一段求扩散系数，不考虑所截取直线横坐标时间段长度的差异，所求出来的扩散系数，是否具有对比性？
赞一下 回复此楼
5楼2017-05-01 22:00:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
1、跑不出原本区域
不太清楚为什么一定要跑出原本的区域
可能是新加的原子的作用，另外看看参数、力场是不是合适

2、初始速度只有random和current两种，默认random
The temperature and the distribution of atomic velocities in a system are related through the Maxwell-Boltzmann equation——摘自help
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2017-04-26 15:25:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

流火七月

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2017-04-26 15:25:28
1、跑不出原本区域
不太清楚为什么一定要跑出原本的区域
可能是新加的原子的作用，另外看看参数、力场是不是合适

2、初始速度只有random和current两种，默认random
The temperature and the distribution of  ...

分子筛的结构里有很多种元环，location在六元环内，MD模拟的结构就只是在这个六元环内，如果分子在MD的过程中没有途径整个分子筛，算出来的扩散系数就不对吧
我都跑了4000ps了，MSD曲线的纵坐标才不超过10，有的还零点几，而且MSD曲线还是小波浪线
赞一下 回复此楼
3楼2017-04-26 21:23:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
分子在MD的过程中没有途径整个分子筛，算出来的扩散系数就不对
——没听过这个说法

4000ps时间感觉有点长，不知道是不是你的结构比较特殊所以要这么长
我看到的一般分子筛是时长在200ps，取当中接近直线的一段求扩散系数
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2017-04-29 08:54:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 02:01 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +22 羊腰板 2026-08-21 25/1250 2026-08-26 15:00 by zuocuiping
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +4 叶九微 2026-08-26 4/200 2026-08-26 10:52 by xiacongxu
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭