24小时热门版块排行榜    

查看: 1158  |  回复: 10

wittymadder

新虫 (正式写手)

[求助] 优化过渡态出现了两个负频

优化过渡态出现了两个负频,该如何调整初始结构呢?(第二个负频是不需要的~)优化过渡态出现了两个负频
%5DYOS6SO}P5]W35(]ZLX4W.png
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : (3)tsaaaa.out
  • 2017-04-23 16:16:48, 651.9 K
  • 附件 2 : (3)tsaaaa.gjf
  • 2017-04-23 16:20:48, 1.25 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

含能材料

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
看看第二个振动的方向,然后把原子朝着与振动方向相反的位置微调,试一试

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2017-04-23 21:32:10
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 含能材料 at 2017-04-23 21:32:10
看看第二个振动的方向,然后把原子朝着与振动方向相反的位置微调,试一试

是改键角吗?我试试~

发自小木虫Android客户端
3楼2017-04-23 22:35:08
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

h840473807

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by wittymadder at 2017-04-23 22:35:08
是改键角吗?我试试~
...

不一定只是键角改变,一种振动形式可能键长键角都发生了改变,建议在结果文件中找到频率振动形式的坐标,将振动坐标乘个系数(比如0.3)再加上分子坐标,将得到的新的坐标进行优化

发自小木虫Android客户端
4楼2017-04-23 23:49:05
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by h840473807 at 2017-04-23 23:49:05
不一定只是键角改变,一种振动形式可能键长键角都发生了改变,建议在结果文件中找到频率振动形式的坐标,将振动坐标乘个系数(比如0.3)再加上分子坐标,将得到的新的坐标进行优化
...

在小木虫上看到尝试了这个方法~和过渡态相差的更远了
优化过渡态出现了两个负频-1



发自小木虫Android客户端
5楼2017-04-24 00:04:29
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

改了键角并没有什么用…

发自小木虫Android客户端
6楼2017-04-24 20:31:54
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

手机端好像不能加金币…没有人回答

发自小木虫Android客户端
7楼2017-04-24 23:40:02
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果调整角度不行 那可以尝试调整一下方法
# opt=(ts,calcall,maxstep=10,noeigen,gdiis) b3lyp/6-31g(d)

calcall虽然很费时间 但是有时候可以让结构找的比较准
gdiis 是另一种opt的方法 可以在某些情况下优化到想要的结构

大概算了下 是可以得到一个虚频的结构的。

output 附上了

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : tsaaaa.log
  • 2017-04-25 00:51:16, 1.36 M

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

8楼2017-04-25 00:51:55
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by paramecium86 at 2017-04-25 00:51:55
如果调整角度不行 那可以尝试调整一下方法
# opt=(ts,calcall,maxstep=10,noeigen,gdiis) b3lyp/6-31g(d)

calcall虽然很费时间 但是有时候可以让结构找的比较准
gdiis 是另一种opt的方法 可以在某些情况下优 ...

这不是我要找的过渡态~我要找的是两个氢在同一个氧上的质子转移。不过还是谢谢啦~

发自小木虫Android客户端
9楼2017-04-25 11:02:06
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

10楼2017-04-26 13:49:56
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wittymadder 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070300化学319求调剂 +6 锦鲤0909 2026-03-17 6/300 2026-03-18 13:22 by Iveryant
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +6 Liwangman 2026-03-15 6/300 2026-03-18 13:21 by 尽舜尧1
[教师之家] 焦虑 +8 水冰月月野兔 2026-03-13 11/550 2026-03-18 13:10 by 水冰月月野兔
[考研] 312求调剂 +8 陌宸希 2026-03-16 9/450 2026-03-18 12:39 by Linda Hu
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +4 脱颖而出 2026-03-16 8/400 2026-03-18 12:05 by 上岸上岸……..
[考研] 0703化学336分求调剂 +6 zbzihdhd 2026-03-15 7/350 2026-03-18 09:53 by zhukairuo
[考研] 材料工程专硕调剂 +5 204818@lcx 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:27 by Little-xue
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +16 不知道叫什么! 2026-03-15 18/900 2026-03-17 17:05 by ruiyingmiao
[考研] 293求调剂 +6 世界首富 2026-03-11 6/300 2026-03-17 17:04 by ruiyingmiao
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧, 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 308 085701 四六级已过求调剂 +7 温乔乔乔乔 2026-03-12 14/700 2026-03-14 10:49 by JourneyLucky
[考研] 315求调剂 +9 小羊小羊_ 2026-03-11 10/500 2026-03-13 21:13 by SXNU李老师
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-12 5/250 2026-03-13 15:56 by 棒棒球手
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
信息提示
请填处理意见