24小时热门版块排行榜    

查看: 1329  |  回复: 10

wittymadder

新虫 (正式写手)

[求助] 优化过渡态出现了两个负频

优化过渡态出现了两个负频,该如何调整初始结构呢?(第二个负频是不需要的~)优化过渡态出现了两个负频
%5DYOS6SO}P5]W35(]ZLX4W.png
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : (3)tsaaaa.out
  • 2017-04-23 16:16:48, 651.9 K
  • 附件 2 : (3)tsaaaa.gjf
  • 2017-04-23 16:20:48, 1.25 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

含能材料

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
看看第二个振动的方向,然后把原子朝着与振动方向相反的位置微调,试一试

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2017-04-23 21:32:10
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 含能材料 at 2017-04-23 21:32:10
看看第二个振动的方向,然后把原子朝着与振动方向相反的位置微调,试一试

是改键角吗?我试试~

发自小木虫Android客户端
3楼2017-04-23 22:35:08
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

h840473807

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by wittymadder at 2017-04-23 22:35:08
是改键角吗?我试试~
...

不一定只是键角改变,一种振动形式可能键长键角都发生了改变,建议在结果文件中找到频率振动形式的坐标,将振动坐标乘个系数(比如0.3)再加上分子坐标,将得到的新的坐标进行优化

发自小木虫Android客户端
4楼2017-04-23 23:49:05
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by h840473807 at 2017-04-23 23:49:05
不一定只是键角改变,一种振动形式可能键长键角都发生了改变,建议在结果文件中找到频率振动形式的坐标,将振动坐标乘个系数(比如0.3)再加上分子坐标,将得到的新的坐标进行优化
...

在小木虫上看到尝试了这个方法~和过渡态相差的更远了
优化过渡态出现了两个负频-1



发自小木虫Android客户端
5楼2017-04-24 00:04:29
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

改了键角并没有什么用…

发自小木虫Android客户端
6楼2017-04-24 20:31:54
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

手机端好像不能加金币…没有人回答

发自小木虫Android客户端
7楼2017-04-24 23:40:02
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果调整角度不行 那可以尝试调整一下方法
# opt=(ts,calcall,maxstep=10,noeigen,gdiis) b3lyp/6-31g(d)

calcall虽然很费时间 但是有时候可以让结构找的比较准
gdiis 是另一种opt的方法 可以在某些情况下优化到想要的结构

大概算了下 是可以得到一个虚频的结构的。

output 附上了

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : tsaaaa.log
  • 2017-04-25 00:51:16, 1.36 M

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

8楼2017-04-25 00:51:55
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by paramecium86 at 2017-04-25 00:51:55
如果调整角度不行 那可以尝试调整一下方法
# opt=(ts,calcall,maxstep=10,noeigen,gdiis) b3lyp/6-31g(d)

calcall虽然很费时间 但是有时候可以让结构找的比较准
gdiis 是另一种opt的方法 可以在某些情况下优 ...

这不是我要找的过渡态~我要找的是两个氢在同一个氧上的质子转移。不过还是谢谢啦~

发自小木虫Android客户端
9楼2017-04-25 11:02:06
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wittymadder

新虫 (正式写手)

10楼2017-04-26 13:49:56
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wittymadder 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ero8OE6tv9cu 2026-09-02 4/200 2026-09-03 03:14 by rM1TE0WVDIIY
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +14 Kittylucky 2026-08-27 15/750 2026-09-02 19:35 by liumei0601
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +7 瞬息宇宙 2026-09-01 14/700 2026-09-02 17:33 by ma0526
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
信息提示
请填处理意见