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shengang404

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助 ISSR数据分析的方法和操作步骤NTSYS软件和popgene软件及使用程 已有1人参与

想用ISSR标记做遗传多样性分析,ISSR结果已经做出来了,求助 ISSR数据分析的方法和操作步骤,NTSYS软件和popgene软件及使用教程,邮箱:shengang404@163.com,衷心感谢!
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我欲乘风归去

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 潇湘妃子。 at 2017-06-06 21:50:01
感谢你的回答!其实我也是看了一些做ISSR的文献,基本都是用UBC随机引物PCR扩增后,开始统计条带,然后用NTSYS,POPGENE进行ISSR的多态性分析。对于这俩软件我还有些困惑:
是不是NTSYS软件是为了最终得到那个材料 ...

1. NTSYS得到的只是个体和个体之间的聚类图,如果你想得到UPGMA聚类图,还是得靠popgene。

2. 我说的话可能有误解,如果你想把这18个不同地区做群体,你起码得取360个样,如果有些地区实在找不到样品那就没办法。但你每个地区就取一个样本,这没法分析,根本没有统计学意义。如果你想补救,确定做哪个地区和哪个地区的多样性分析,尽可能的夺取样(>20)。
。
7楼2017-06-06 22:07:51
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我欲乘风归去

木虫 (正式写手)

。
2楼2017-04-23 17:40:25
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shengang404

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 我欲乘风归去 at 2017-04-23 17:40:25
https://wenku.baidu.com/view/43ce56dd3186bceb19e8bb12.html

真心感谢你的帮助,你提供给我的之前我已经下载了,我需要软件,和具体分析方法
3楼2017-04-23 18:15:01
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潇湘妃子。

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 我欲乘风归去 at 2017-04-23 17:40:25
https://wenku.baidu.com/view/43ce56dd3186bceb19e8bb12.html

您好,看了您发的帖子,感觉对这方面应该比较了解了,特来请教。我最近也在做这个ISSR,用NTSYS分析聚类结果。我用了18个不同的样品,20种不同引物(每个引物有14个条带位点)。遇到的问题是:在使用NTSYS这个软件分析时,对于每一种引物而言,做成的是一个14行,18列的0,1矩阵excel表,可看到木虫里大家都说应该把这20种引物的0,1数据放在一个excel表中去分析,如果是这样的话,那就成了一个280行,18列的excel表,
求问:
1、在excel的第一行是不是应该写1,280,18,0  ?
2、每种引物的位点分别为100bp,200bp,300bp……1000bp,2000bp,3000bp。将所有引物的0,1数据写在一起的意思是说,第一种引物从100bp ~3000bp写完后再写第二个引物,直到写完第20种引物的数据信息吗?
3、如果按照2来操作,这么多数据混合在一起,能识别吗?还是说在最前面添加一列引物的名字做个说明?
还请帮帮忙,不知道怎么继续分析了,感谢感谢~
4楼2017-06-06 17:52:22
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