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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

[求助] vasp中计算CI-NEB求助 已有1人参与

vasp中计算CI-NEB时,会构建6个文件夹,00,01,02,03,04,05,00与05分别对应的初末态。通过在中间构建4个态,也就是这里的01-04,优化这4个态的结构,得到相应的能量,这里计算的过程是优化,那么这几个结构在优化的过程中将趋近于最优结构,而在构建这4个态的时是按照一种等分距离来得到的初始结构,所以优化后结构应该会变化很大,我自己计算CO2裂解为CO的过程中,感觉中间好像没有那么多稳定的中间态,我尝试了优化发现01-04这4个结构有几个优化后结构相同,而有的甚至跑到了初末态了,这种情况下,应该如何调节这个中间态?如附上图所示,想得到类似这样的过渡态,但我计算的中间态都有些问题,而图中所示的中间态都是优化后结构吗?求指教!

vasp中计算CI-NEB求助
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知與誰同,與狼共舞。
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interding

金虫 (正式写手)

★ ★
漫天飘雪: 金币+2, 谢谢交流! 2017-04-21 23:12:02
这里面没有你自己的结果吧?而且你中间怎么会插入4个点的,我们一般都是5个或者7个image
2楼2017-04-21 06:35:09
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

引用回帖:
2楼: Originally posted by interding at 2017-04-21 06:35:09
这里面没有你自己的结果吧?而且你中间怎么会插入4个点的,我们一般都是5个或者7个image

恩,这里是我摘取自文献中的图,重点不是插入几个点的问题,而是怎么得到稳定的中间态?....
知與誰同,與狼共舞。
3楼2017-04-21 15:22:26
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周先森回家了

金虫 (著名写手)

★ ★
pcczhouwei(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流! 2017-04-21 23:11:50
感觉中间好像没有那么多稳定的中间态,我尝试了优化发现01-04这4个结构有几个优化后结构相同,而有的甚至跑到了初末态了。。这种情况是正常吧,他们不是跑到初末态,只是像而已,还是有差别,正常过程就是这样子变化

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尽自己最大的努力朝着正确的方向去做,远离拖延症~(2016-12-12)
4楼2017-04-21 15:46:47
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

引用回帖:
4楼: Originally posted by 周先森回家了 at 2017-04-21 15:46:47
感觉中间好像没有那么多稳定的中间态,我尝试了优化发现01-04这4个结构有几个优化后结构相同,而有的甚至跑到了初末态了。。这种情况是正常吧,他们不是跑到初末态,只是像而已,还是有差别,正常过程就是这样子变化 ...

没有,就是中间态优化后,01与02和初态相同,04与末态相同。会不会是初末态距离太近,中间没有那么多稳定结构?
知與誰同,與狼共舞。
5楼2017-04-21 20:44:08
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周先森回家了

金虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by pcczhouwei at 2017-04-21 20:44:08
没有,就是中间态优化后,01与02和初态相同,04与末态相同。会不会是初末态距离太近,中间没有那么多稳定结构?...

这样子就是正常啊,反正我算得差不多是这样子

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尽自己最大的努力朝着正确的方向去做,远离拖延症~(2016-12-12)
6楼2017-04-21 22:52:03
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zyqh

铁杆木虫 (著名写手)

请问这是VASP计算分子动力学的内容吗?
雨后方能见彩虹
7楼2017-04-21 23:14:04
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 周先森回家了 at 2017-04-21 22:52:03
这样子就是正常啊,反正我算得差不多是这样子
...

好吧,我再计算的看看,谢谢!
知與誰同,與狼共舞。
8楼2017-04-22 10:17:57
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

引用回帖:
7楼: Originally posted by zyqh at 2017-04-21 23:14:04
请问这是VASP计算分子动力学的内容吗?

VASP中CI-NEB计算过渡态。
知與誰同,與狼共舞。
9楼2017-04-22 10:18:09
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冯亚娟

金虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by pcczhouwei at 2017-04-22 10:18:09
VASP中CI-NEB计算过渡态。...

请问楼主是否知道:计算完过渡态需要进行频率计算是怎样操作的呢?是不是计算声子谱的过程?
10楼2017-04-24 21:42:51
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