应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp中计算CI-NEB求助
121/2返回列表12下一页
查看: 2622  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

[求助] vasp中计算CI-NEB求助 已有1人参与

vasp中计算CI-NEB时，会构建6个文件夹，00,01,02,03,04,05，00与05分别对应的初末态。通过在中间构建4个态，也就是这里的01-04，优化这4个态的结构，得到相应的能量，这里计算的过程是优化，那么这几个结构在优化的过程中将趋近于最优结构，而在构建这4个态的时是按照一种等分距离来得到的初始结构，所以优化后结构应该会变化很大，我自己计算CO2裂解为CO的过程中，感觉中间好像没有那么多稳定的中间态，我尝试了优化发现01-04这4个结构有几个优化后结构相同，而有的甚至跑到了初末态了，这种情况下，应该如何调节这个中间态？如附上图所示，想得到类似这样的过渡态，但我计算的中间态都有些问题，而图中所示的中间态都是优化后结构吗？求指教！

vasp中计算CI-NEB求助
图片1.png
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

NEB计算

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
知與誰同，與狼共舞。
1楼 2017-04-20 21:02:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

interding

金虫 (正式写手)
★ ★
漫天飘雪: 金币+2, 谢谢交流！ 2017-04-21 23:12:02
这里面没有你自己的结果吧？而且你中间怎么会插入4个点的，我们一般都是5个或者7个image
赞一下 回复此楼
2楼2017-04-21 06:35:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
引用回帖:
2楼: Originally posted by interding at 2017-04-21 06:35:09
这里面没有你自己的结果吧？而且你中间怎么会插入4个点的，我们一般都是5个或者7个image

恩，这里是我摘取自文献中的图，重点不是插入几个点的问题，而是怎么得到稳定的中间态？....
赞一下 回复此楼
知與誰同，與狼共舞。
3楼2017-04-21 15:22:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

周先森回家了

金虫 (著名写手)
★ ★
pcczhouwei(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流！ 2017-04-21 23:11:50
感觉中间好像没有那么多稳定的中间态，我尝试了优化发现01-04这4个结构有几个优化后结构相同，而有的甚至跑到了初末态了。。这种情况是正常吧，他们不是跑到初末态，只是像而已，还是有差别，正常过程就是这样子变化

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
尽自己最大的努力朝着正确的方向去做，远离拖延症~（2016-12-12）
4楼2017-04-21 15:46:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
引用回帖:
4楼: Originally posted by 周先森回家了 at 2017-04-21 15:46:47
感觉中间好像没有那么多稳定的中间态，我尝试了优化发现01-04这4个结构有几个优化后结构相同，而有的甚至跑到了初末态了。。这种情况是正常吧，他们不是跑到初末态，只是像而已，还是有差别，正常过程就是这样子变化 ...

没有，就是中间态优化后，01与02和初态相同，04与末态相同。会不会是初末态距离太近，中间没有那么多稳定结构？
赞一下 回复此楼
知與誰同，與狼共舞。
5楼2017-04-21 20:44:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

周先森回家了

金虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by pcczhouwei at 2017-04-21 20:44:08
没有，就是中间态优化后，01与02和初态相同，04与末态相同。会不会是初末态距离太近，中间没有那么多稳定结构？...

这样子就是正常啊，反正我算得差不多是这样子

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

pcczhouwei
尽自己最大的努力朝着正确的方向去做，远离拖延症~（2016-12-12）
6楼2017-04-21 22:52:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zyqh

铁杆木虫 (著名写手)
请问这是VASP计算分子动力学的内容吗？
赞一下 回复此楼
雨后方能见彩虹
7楼2017-04-21 23:14:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 周先森回家了 at 2017-04-21 22:52:03
这样子就是正常啊，反正我算得差不多是这样子
...

好吧，我再计算的看看，谢谢！
赞一下 回复此楼
知與誰同，與狼共舞。
8楼2017-04-22 10:17:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
引用回帖:
7楼: Originally posted by zyqh at 2017-04-21 23:14:04
请问这是VASP计算分子动力学的内容吗？

VASP中CI-NEB计算过渡态。
赞一下 回复此楼
知與誰同，與狼共舞。
9楼2017-04-22 10:18:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冯亚娟

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by pcczhouwei at 2017-04-22 10:18:09
VASP中CI-NEB计算过渡态。...

请问楼主是否知道：计算完过渡态需要进行频率计算是怎样操作的呢？是不是计算声子谱的过程？
赞一下 回复此楼
10楼2017-04-24 21:42:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pcczhouwei 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 281求调剂（0805） +6 烟汐忆海 2026-03-16 16/800 2026-03-19 00:59 by 烟汐忆海
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +8 SUICHILD 2026-03-12 8/400 2026-03-18 20:55 by winsuccess
[考研] 材料专硕英一数二306 +4 z1z2z3879 2026-03-18 4/200 2026-03-18 20:00 by 楤哥
[考研] 085601专硕，总分342求调剂，地区不限 +5 share_joy 2026-03-16 5/250 2026-03-18 14:48 by haxia
[考研] 297求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-17 8/400 2026-03-18 14:30 by laoshidan
[考研] 0703化学调剂 +3 妮妮ninicgb 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:29 by macy2011
[考研] 材料专硕326求调剂 +6 墨煜姒莘 2026-03-15 7/350 2026-03-17 17:10 by ruiyingmiao
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林，给自己招师弟中～ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-15 6/300 2026-03-17 11:05 by 学员h26Tkc
[考研] 285化工学硕求调剂（081700） +9 柴郡猫_ 2026-03-12 9/450 2026-03-17 10:18 by Sammy2
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 一志愿华中师范071000，325求调剂 +6 RuitingC 2026-03-12 6/300 2026-03-16 14:50 by 可淡不可忘
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 311求调剂 +3 冬十三 2026-03-13 3/150 2026-03-13 20:41 by JourneyLucky
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 290求调剂 +3 ADT 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:19 by peike
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭