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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf

[求助] vasp中计算CI-NEB求助 已有1人参与

vasp中计算CI-NEB时，会构建6个文件夹，00,01,02,03,04,05，00与05分别对应的初末态。通过在中间构建4个态，也就是这里的01-04，优化这4个态的结构，得到相应的能量，这里计算的过程是优化，那么这几个结构在优化的过程中将趋近于最优结构，而在构建这4个态的时是按照一种等分距离来得到的初始结构，所以优化后结构应该会变化很大，我自己计算CO2裂解为CO的过程中，感觉中间好像没有那么多稳定的中间态，我尝试了优化发现01-04这4个结构有几个优化后结构相同，而有的甚至跑到了初末态了，这种情况下，应该如何调节这个中间态？如附上图所示，想得到类似这样的过渡态，但我计算的中间态都有些问题，而图中所示的中间态都是优化后结构吗？求指教！

vasp中计算CI-NEB求助
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知與誰同，與狼共舞。
1楼 2017-04-20 21:02:34
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interding

金虫 (正式写手)
★ ★
漫天飘雪: 金币+2, 谢谢交流！ 2017-04-21 23:12:02
这里面没有你自己的结果吧？而且你中间怎么会插入4个点的，我们一般都是5个或者7个image
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2楼2017-04-21 06:35:09
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
引用回帖:
2楼: Originally posted by interding at 2017-04-21 06:35:09
这里面没有你自己的结果吧？而且你中间怎么会插入4个点的，我们一般都是5个或者7个image

恩，这里是我摘取自文献中的图，重点不是插入几个点的问题，而是怎么得到稳定的中间态？....
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知與誰同，與狼共舞。
3楼2017-04-21 15:22:26
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周先森回家了

金虫 (著名写手)
★ ★
pcczhouwei(漫天飘雪代发): 金币+2, 谢谢交流！ 2017-04-21 23:11:50
感觉中间好像没有那么多稳定的中间态，我尝试了优化发现01-04这4个结构有几个优化后结构相同，而有的甚至跑到了初末态了。。这种情况是正常吧，他们不是跑到初末态，只是像而已，还是有差别，正常过程就是这样子变化

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尽自己最大的努力朝着正确的方向去做，远离拖延症~（2016-12-12）
4楼2017-04-21 15:46:47
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
引用回帖:
4楼: Originally posted by 周先森回家了 at 2017-04-21 15:46:47
感觉中间好像没有那么多稳定的中间态，我尝试了优化发现01-04这4个结构有几个优化后结构相同，而有的甚至跑到了初末态了。。这种情况是正常吧，他们不是跑到初末态，只是像而已，还是有差别，正常过程就是这样子变化 ...

没有，就是中间态优化后，01与02和初态相同，04与末态相同。会不会是初末态距离太近，中间没有那么多稳定结构？
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知與誰同，與狼共舞。
5楼2017-04-21 20:44:08
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周先森回家了

金虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by pcczhouwei at 2017-04-21 20:44:08
没有，就是中间态优化后，01与02和初态相同，04与末态相同。会不会是初末态距离太近，中间没有那么多稳定结构？...

这样子就是正常啊，反正我算得差不多是这样子

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pcczhouwei
尽自己最大的努力朝着正确的方向去做，远离拖延症~（2016-12-12）
6楼2017-04-21 22:52:03
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zyqh

铁杆木虫 (著名写手)
请问这是VASP计算分子动力学的内容吗？
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雨后方能见彩虹
7楼2017-04-21 23:14:04
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 周先森回家了 at 2017-04-21 22:52:03
这样子就是正常啊，反正我算得差不多是这样子
...

好吧，我再计算的看看，谢谢！
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知與誰同，與狼共舞。
8楼2017-04-22 10:17:57
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pcczhouwei

铁杆木虫 (著名写手)

Wolf
引用回帖:
7楼: Originally posted by zyqh at 2017-04-21 23:14:04
请问这是VASP计算分子动力学的内容吗？

VASP中CI-NEB计算过渡态。
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知與誰同，與狼共舞。
9楼2017-04-22 10:18:09
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冯亚娟

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by pcczhouwei at 2017-04-22 10:18:09
VASP中CI-NEB计算过渡态。...

请问楼主是否知道：计算完过渡态需要进行频率计算是怎样操作的呢？是不是计算声子谱的过程？
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10楼2017-04-24 21:42:51
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