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chemdeer

新虫 (初入文坛)

[求助] 计算弱相互作用的分子搭建

大家好。我现在要计算一个金属和配体间的弱相互作用。配体的甲基会因为这个作用而发生形变,比如键长键角会偏离标准的甲基的键长键角。请问我应该怎么搭建这个分子呢?

我之前搭建的结构一优化,分子结构就散掉了,得不到文献上的结构。用的是b3lyp+d/def2-svp 算的。
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122ybb

银虫 (小有名气)

根据文献中的结构构建初始结构,先用HF方法优化,再用DFT优化
明天比今天更好!
2楼2017-04-17 20:27:23
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hfds496

铁虫 (初入文坛)

金属不用赝势吗?还有b3lyp处理金属和弱相互作用都不是很好

发自小木虫Android客户端
3楼2017-04-17 21:57:57
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papaxia

至尊木虫 (著名写手)

4楼2017-04-18 06:52:22
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chemdeer

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 122ybb at 2017-04-17 20:27:23
根据文献中的结构构建初始结构,先用HF方法优化,再用DFT优化

Thank you. I used the same structure, method,and basis sets as the literature, but the metal still not bonded with the ligand. What is wrong?
5楼2017-04-19 14:38:08
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122ybb

银虫 (小有名气)

高斯显示金属和配体间没有键连是正常的,好多都会出现这种情况,不是说没有显示就没成键,高斯是根据距离显示是否成键的。只要优化正常结束,结构合适就可以了。

发自小木虫Android客户端
明天比今天更好!
6楼2017-04-19 15:14:20
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chemdeer

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 122ybb at 2017-04-19 15:14:20
高斯显示金属和配体间没有键连是正常的,好多都会出现这种情况,不是说没有显示就没成键,高斯是根据距离显示是否成键的。只要优化正常结束,结构合适就可以了。

原来这样。谢谢!我怎么把金币给你?没有这个按钮。
7楼2017-04-20 00:25:12
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