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zzm7806

[交流] 求助PCR遇到的问题

我的目的基因为单链DNA,在尾部有一段发卡结构,约120nt。在PCR过程中出现问题,不能得到扩增结果。请教各前辈,是否有针对这种情况的扩增酶,或是否有能将其推平的方法。
谢谢大家了!
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)

提高变性温度和时间,提高退火温度
还有用降落PCR
实在不行,加5%(剂量需要摸,以1%为梯度,但一般很少用到15%)左右的DMSO
2楼2009-01-04 09:58:07
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zzm7806

感谢

引用回帖:
Originally posted by 三磷酸腺苷 at 2009-1-4 09:58:
提高变性温度和时间,提高退火温度
还有用降落PCR
实在不行,加5%(剂量需要摸,以1%为梯度,但一般很少用到15%)左右的DMSO

感谢你的关注和帮助。
我在多次PCR尝试过程中也应用了很多不同的条件(变性温度和时间相应提高、退火温度也试了很多,体系中各成分含量也相应调整过)但是从来都没有出现过我的目的条带。(是一点都没有)
您建议的降落PCR,我没有试过,以前也没有接触过,我了解后尝试一下。
另外,DMSO应用在我的PCR中作用是什么呢?我只知道它与GC含量有点关系。
再次表示感谢!
3楼2009-01-04 14:52:35
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sutao1979

木虫 (著名写手)

小木虫10年groupleader

DMSO应用在我的PCR中作用是什么呢?
可以提高pcr扩增条带的特异性(效率和专一性),扩增一些比较难扩增的模板,一般常用的浓度为2~10%,当DNA 片段模板的GC 含量太高时,DMSO 可以改变引物DNA 模板杂交(Hybridization)的温度(Tm)。但是,过量的dmso也可以抑制模板的扩增,主要是抑制聚合酶的活性,所以,用之前需要小量摸索。
会当凌绝顶,一览众山小
4楼2009-01-04 17:52:11
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