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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 求助基因家族如何进行引物设计？？？
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zhao_shujing

金虫 (小有名气)

[求助] 求助基因家族如何进行引物设计？？？ 已有1人参与

我之前克隆了一个基因，引物是老师设计的，这个基因属于一个基因家族，后来老师想让我把这个家族的其他成员全部克隆出来，让我自己设计引物，但由于该家族基因本身相似度就很高了，通过和拟南芥的同源基因比对能比对出一大串，再反过来比对结果又变了，我也不能确定我比对出来的能和拟南芥的哪一个更配对，该怎么办呀？到底是用核酸比对核酸准确？还是蛋白比对核酸准确？求各路大神指教
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1楼 2017-04-14 10:13:25
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jinnini125

木虫 (小有名气)
根据同源序列，用codehop在线设计兼并引物，可同时扩增一个家族的尽可能多的基因。

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2楼2017-04-14 13:25:52
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yudaoqian88

至尊木虫 (知名作家)

不良人
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhao_shujing at 2017-04-14 21:44:00
玉米

玉米不是有现成的基因组可以直接调取序列吧
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特别喜欢家门口开门的瞬间，宝宝那个高兴呀，蹦蹦跳跳，好不热闹！
7楼2017-04-14 23:06:15
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普通回帖

yudaoqian88

至尊木虫 (知名作家)

不良人
做什么植物呢？

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特别喜欢家门口开门的瞬间，宝宝那个高兴呀，蹦蹦跳跳，好不热闹！
3楼2017-04-14 14:50:48
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zhao_shujing

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jinnini125 at 2017-04-14 13:25:52
根据同源序列，用codehop在线设计兼并引物，可同时扩增一个家族的尽可能多的基因。

但是我想知道我克隆的基因对应拟南芥中哪个同源基因呀
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4楼2017-04-14 21:43:27
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zhao_shujing

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yudaoqian88 at 2017-04-14 14:50:48
做什么植物呢？

玉米
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5楼2017-04-14 21:44:00
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zhao_shujing

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yudaoqian88 at 2017-04-14 14:50:48
做什么植物呢？

玉米
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6楼2017-04-14 21:44:41
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zhao_shujing

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by yudaoqian88 at 2017-04-14 23:06:15
玉米不是有现成的基因组可以直接调取序列吧...

玉米整个基因组测序结果是已经出来了，但是并不知道哪个片段对应什么基因，有什么功能啊
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8楼2017-04-15 09:35:03
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匿名

用户注销 (正式写手)
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9楼2017-04-15 23:42:17
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jinnini125

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
8楼: Originally posted by zhao_shujing at 2017-04-15 09:35:03
玉米整个基因组测序结果是已经出来了，但是并不知道哪个片段对应什么基因，有什么功能啊...

你把拟南芥的全部基因调出来，挨个去玉米基因组里比对

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10楼2017-04-16 09:58:54
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