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1612271362

新虫 (初入文坛)

[求助] GULP优化含铝分子筛结构时总会出现H游离的现象,该如何解决? 已有1人参与

用GULP优化含铝分子筛结构时总会出现H游离(H本来该连在O上,结果却飞走了)的现象,对于含多个H的结构,加connect选项貌似也没管用。请问该如何解决这个问题呢?
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源鹭

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
1612271362: 金币+10, 有帮助 2017-04-14 09:21:13
我最近在用gulp做分子筛间断结构的优化,结构中也会有羟基H,并没有出现楼主说的H飞出去的情况呢。
倒是T-O-H的键角感觉优化的不是很合理,不知楼主选用的是哪种力场优化的?使用哪个版本的gulp呢?
不念过去,不畏将来
2楼2017-04-13 22:02:07
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1612271362

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 源鹭 at 2017-04-13 22:02:07
我最近在用gulp做分子筛间断结构的优化,结构中也会有羟基H,并没有出现楼主说的H飞出去的情况呢。
倒是T-O-H的键角感觉优化的不是很合理,不知楼主选用的是哪种力场优化的?使用哪个版本的gulp呢?

感谢你的回复,我用的gulp4.4版的,catlow力场。附件中附上了我的输入输出文件,在cif结构中可以看到有H飞走的情况,麻烦您帮我看一下吧,感激不尽!

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  • 附件 1 : 001.cif
  • 2017-04-14 09:10:47, 34.23 K
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  • 2017-04-14 09:10:48, 51.93 K
  • 附件 3 : 001.gout
  • 2017-04-14 09:10:51, 388.46 K
3楼2017-04-14 09:20:14
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