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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » ME/Gulp » GULP优化含铝分子筛结构时总会出现H游离的现象，该如何解决？
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1612271362

新虫 (初入文坛)

[求助] GULP优化含铝分子筛结构时总会出现H游离的现象，该如何解决？ 已有1人参与

用GULP优化含铝分子筛结构时总会出现H游离（H本来该连在O上，结果却飞走了）的现象，对于含多个H的结构，加connect选项貌似也没管用。请问该如何解决这个问题呢？
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1楼 2017-04-13 17:24:10
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源鹭

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
1612271362: 金币+10, ★有帮助 2017-04-14 09:21:13
我最近在用gulp做分子筛间断结构的优化，结构中也会有羟基H,并没有出现楼主说的H飞出去的情况呢。
倒是T-O-H的键角感觉优化的不是很合理，不知楼主选用的是哪种力场优化的？使用哪个版本的gulp呢？
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不念过去，不畏将来
2楼2017-04-13 22:02:07
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1612271362

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 源鹭 at 2017-04-13 22:02:07
我最近在用gulp做分子筛间断结构的优化，结构中也会有羟基H,并没有出现楼主说的H飞出去的情况呢。
倒是T-O-H的键角感觉优化的不是很合理，不知楼主选用的是哪种力场优化的？使用哪个版本的gulp呢？

感谢你的回复，我用的gulp4.4版的，catlow力场。附件中附上了我的输入输出文件，在cif结构中可以看到有H飞走的情况，麻烦您帮我看一下吧，感激不尽！
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  • 附件 1 : 001.cif
    • 2017-04-14 09:10:47, 34.23 K
  • 附件 2 : 001.gin
    • 2017-04-14 09:10:48, 51.93 K
  • 附件 3 : 001.gout
    • 2017-04-14 09:10:51, 388.46 K
3楼2017-04-14 09:20:14
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