| 查看: 1866 | 回复: 1 | |||
[求助]
VMD建立的membrane模型有问题？有什么好的方法或模型吗？（磷脂双分子层模型） 已有1人参与
|
|
我要用vmd构建了popc在立场charmm27立场下的的模型，但是出现了部分原子的干涉。发现一个问题就是vmd的bilayer lipid 的原模型不是固定的，就是当我的X Y长度不同时会导致单位面积的原子数不同（就是所取patch大小不同，会导致单面积原子密度不同）。也就是说这样的情况下我无法决定最适合的模型，而且出现干涉现象。 故想请教大家下有什么比较好的建模方式，我用的namd。有说用amder的，因为不是很熟悉，有相关的教程吗？ 如果可以的话，能分享一些popc pope dppc 的bilayer lipid的模型吗？ 谢谢大家  |
回复此楼» 猜你喜欢
面上5B能上会吗？
已经有4人回复
-
329求调剂，一志愿西北工业大学，材料工程（085601）
已经有9人回复
-
322求调剂：一志愿湖南大学 材料与化工（085600），已过六级。
已经有4人回复
-
085600 材料与化工 329分求调剂
已经有14人回复
-
材料科学与工程求调剂
已经有3人回复
-
289求调剂
已经有5人回复
-
化学工程085602 305分求调剂
已经有21人回复
-
26申博自荐
已经有5人回复
-
296求调剂
已经有5人回复
-
总分293求调剂
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
2楼2017-04-11 14:58:04
