| 查看: 1858 | 回复: 1 | ||
[求助]
VMD建立的membrane模型有问题？有什么好的方法或模型吗？（磷脂双分子层模型） 已有1人参与
|
|
我要用vmd构建了popc在立场charmm27立场下的的模型，但是出现了部分原子的干涉。发现一个问题就是vmd的bilayer lipid 的原模型不是固定的，就是当我的X Y长度不同时会导致单位面积的原子数不同（就是所取patch大小不同，会导致单面积原子密度不同）。也就是说这样的情况下我无法决定最适合的模型，而且出现干涉现象。 故想请教大家下有什么比较好的建模方式，我用的namd。有说用amder的，因为不是很熟悉，有相关的教程吗？ 如果可以的话，能分享一些popc pope dppc 的bilayer lipid的模型吗？ 谢谢大家  |
回复此楼» 猜你喜欢
302求调剂
已经有4人回复
-
被我言中：新模板不强调格式了，假专家开始管格式了
已经有4人回复
-
303求调剂
已经有5人回复
-
考研求调剂
已经有4人回复
-
085601专硕，总分342求调剂，地区不限
已经有4人回复
-
085601材料工程专硕求调剂
已经有5人回复
-
一志愿天津大学化学工艺专业（081702）315分求调剂
已经有6人回复
-
能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名
已经有6人回复
-
296求调剂
已经有5人回复
-
0703化学调剂 ，六级已过，有科研经历
已经有8人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
2楼2017-04-11 14:58:04
