24小时热门版块排行榜    

查看: 649  |  回复: 1

实验用木虫

新虫 (初入文坛)

[求助] RepeatMasker能不能对输出结果做一些筛选

现在我自己按照RepeatMasker的要求,建了一个很小的重复序列数据库,用-lib参数选它就可以成功从基因组里边找出来这个数据库里的序列。但是找出来的结果,比如说我自己的数据库里某条序列长度是800bp,但是找出来能跟这条序列对上的,从80bp到800bp都有,想知道哪个参数可以设置一下这个长度,比如说只会找出来长度大于600bp(参考序列长度75%)的序列?看到有个-div参数,但是很奇怪,用-div 90这个参数跑了一遍后跟没有设置这个参数的结果是一样的。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

发疯的脚趾头

新虫 (初入文坛)

你好,我想请问repeatmasker的结果怎么看,query sequence怎么会有很多重复的?
2楼2018-01-23 10:06:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 实验用木虫 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 考研复试调剂,过国家线的同学都可报名 +4 黑!在干嘛 2026-02-28 5/250 2026-03-02 16:48 by chock1337
[考研] 求调剂 +9 yunziaaaaa 2026-03-01 10/500 2026-03-02 15:18 by 半截的诗0927
[考研] 江苏省农科院招调剂1名 +4 Qwertyuop 2026-03-01 4/200 2026-03-02 14:27 by 升格阿达
[考博] 诚招农业博士 +3 心欣向荣 2026-02-28 3/150 2026-03-02 13:33 by 时间不狗
[考研] 材料工程274求调剂 +4 Lilithan 2026-03-01 4/200 2026-03-02 12:06 by yuchj
[考研] 268求调剂 +4 简单点0 2026-03-02 5/250 2026-03-02 11:54 by ms629
[考研] 材料工程专硕283求调剂 5+4 ,!? 2026-03-02 6/300 2026-03-02 11:07 by 黑!在干嘛
[考研] 0854复试调剂 276 +4 wmm9 2026-03-01 6/300 2026-03-02 09:28 by 热情沙漠
[考研] 材料工程269求调剂 +3 白刺玫 2026-03-02 3/150 2026-03-02 09:25 by 一休哥FU
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 13/650 2026-03-02 07:27 by 好好好1233
[考研] 279求调剂 +3 dua1 2026-03-01 4/200 2026-03-02 00:23 by 大脸蛋子
[基金申请] 本子写完了,给DS兄弟看了,得了92分 +3 Doma 2026-03-01 7/350 2026-03-02 00:00 by jnzsy
[考研] 272求调剂 +6 田智友 2026-02-28 6/300 2026-03-01 21:40 by 公瑾逍遥
[考研] 299求调剂 +3 Y墨明棋妙Y 2026-02-28 5/250 2026-03-01 21:01 by tangxiaotian
[考研] 0856材料求调剂 +11 hyf hyf hyf 2026-02-28 12/600 2026-03-01 18:57 by 18137688336
[考研] 291分工科求调剂 +9 science饿饿 2026-03-01 10/500 2026-03-01 18:55 by 18137688336
[考研] 321求调剂一志愿东北林业大学材料与化工英二数二 +4 虫虫虫虫虫7 2026-03-01 7/350 2026-03-01 16:52 by caszguilin
[考研] 求调剂 +6 repeatt?t 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:37 by Sakura绘
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +6 Soliloquy_Q 2026-02-28 11/550 2026-03-01 11:14 by 歌liekkas
[硕博家园] 2025届双非化工硕士毕业,申博 +3 更多的是 2026-02-27 4/200 2026-03-01 10:04 by ztg729
信息提示
请填处理意见