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RepeatMasker能不能对输出结果做一些筛选
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| 现在我自己按照RepeatMasker的要求，建了一个很小的重复序列数据库，用-lib参数选它就可以成功从基因组里边找出来这个数据库里的序列。但是找出来的结果，比如说我自己的数据库里某条序列长度是800bp，但是找出来能跟这条序列对上的，从80bp到800bp都有，想知道哪个参数可以设置一下这个长度，比如说只会找出来长度大于600bp（参考序列长度75%）的序列？看到有个-div参数，但是很奇怪，用-div 90这个参数跑了一遍后跟没有设置这个参数的结果是一样的。 |
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2楼2018-01-23 10:06:37