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瑞文戴雨

新虫 (初入文坛)

[求助] 用xcms分析.mzXML文件出现Error,大神们帮忙看下是什么问题啊

新人第一次使用xcms,遇到了一些问题。在Bioconductor网站上下载了xcms程序包,安装后按照doc文件夹下面的xcmsPreprocess.pdf文档操作,分析faahko时没有问题,但是在分析实验室的数据时(.mzXML格式)出现问题:
>  setwd(cdfpath)
>  list.files(cdfpath, recursive = TRUE)
[1] "prm1.mzXML"  "prm10.mzXML" "prm2.mzXML"  "prm3.mzXML"  "prm4.mzXML"  "prm5.mzXML"  "prm6.mzXML"
[8] "prm7.mzXML"  "prm8.mzXML"  "prm9.mzXML"
> cdffiles <- list.files(cdfpath, recursive = TRUE, full.names = TRUE)
> xset <- xcmsSet(cdffiles)
Error: 'bplapply' receive data failed:
  error reading from connection
Error: failed to stop ‘SOCKcluster’ cluster: error writing to connection
请问各位大神,这是怎么回事啊?

用xcms分析.mzXML文件出现Error,大神们帮忙看下是什么问题啊
QQ截图20170406191319.png
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xu以硕

新虫 (初入文坛)

楼主解决了吗?我最近在这块卡住了,想互相交流一下

发自小木虫IOS客户端
2楼2017-09-14 10:30:08
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小樱x

金虫 (正式写手)

3楼2017-12-20 12:13:53
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微笑的飞鸟

新虫 (小有名气)

请问能把xcms的安装包发我一份吗

发自小木虫Android客户端
4楼2019-10-21 16:19:09
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