24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1040  |  回复: 8
当前主题已经存档。

zongyan

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] [求助]利用Shell脚本进行VASP计算

我根据侯柱峰写的教程中的脚本进行截断能的测试,但是一运行以后就停在done处,各位是否经历过,请帮忙解决一下。以下是脚本:

#!/bin/bash
BIN= ~/vasp
rm WAVECAR
for i in 150 200 250 300 350 400
do
cat > INCAR < System = Si-Diamond
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ENCUT = $i
ISMEAR = -5
PERC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i eV"; time vasp
E = 'grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5}'
echo $i $E >> comment
done

[ Last edited by wuchenwf on 2009-6-22 at 22:13 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

细推物理须行乐,何用浮名绊此生!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

TIGERYZZ

金虫 (小有名气)

★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励讨论!
楼主可不可以把出错的文字贴出来,或者描述的详细一点啊,
脚本运行后停在最后一行语句done处,难道有问题吗?
2楼2008-12-31 20:06:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zongyan

铁杆木虫 (正式写手)

没有出错信息,只是停在done位置上不去了,一般来说如果脚本正确的话,当运行完脚本后就会出来vasp的运算信息的,可是这个脚本就不行,一直停着不动。
细推物理须行乐,何用浮名绊此生!
3楼2009-01-01 09:19:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunray55

银虫 (小有名气)

★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):谢谢,新年快乐
请问楼主是串行还是并行还是单机?
前两者不能简单的用 #sh ***命令
4楼2009-01-01 11:05:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)

★ ★ ★
fegg7502(金币+3,VIP+0):thanks,haha
另外楼主的系统是什么,要是Ubuntu的话,还运行VASP的时候要有 ./vasp
5楼2009-01-01 14:31:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

flywoud

至尊木虫 (正式写手)

有些深奥,慢慢学一下
6楼2009-01-01 14:33:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
Originally posted by flywoud at 2009-1-1 14:33:
有些深奥,慢慢学一下

不深奥,
7楼2009-01-01 15:00:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cheerian

铜虫 (正式写手)

语法上没看出问题......
8楼2009-01-01 15:24:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)

★ ★
fegg7502(金币+2):thank you very much! 1-23 16:00
我想所谓的问题应该是处在这句:
E = 'grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5}'
楼主应该在comment文件里面看不到输出的E值
正确的格式应该是:

E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5}'`
请特别注意最后两个是不同的,一个',另外一个是`
Life, Love, Laugh.
9楼2009-01-23 13:34:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zongyan 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 5/250 2026-04-20 10:47 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 通信工程求调剂!!! +7 zlb770521 2026-04-14 7/350 2026-04-19 20:56 by Equinoxhua
[考研] 26药学专硕105500求调剂 +7 喽哈加油 2026-04-13 8/400 2026-04-19 20:21 by Equinoxhua
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +10 小聂爱学习 2026-04-16 12/600 2026-04-19 16:51 by 中豫男
[考研] 085404 22408 309分求调剂 +10 lzmk 2026-04-14 11/550 2026-04-19 16:42 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 307中医考研调剂 +9 于以采蘩 2026-04-14 9/450 2026-04-19 08:41 by 烟雨流涯
[考研] 327求调剂 +27 Xxjc1107. 2026-04-13 30/1500 2026-04-19 08:22 by cuisz
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[考研] 一志愿沪9,生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[考研] 求调剂学校 +14 不会吃肉 2026-04-13 16/800 2026-04-15 21:59 by noqvsozv
[考研] 297工科调剂? +14 河南农业大学-能 2026-04-13 15/750 2026-04-15 13:25 by 黑科技矿业
[考研] 考研调剂 +13 长弓傲 2026-04-13 14/700 2026-04-14 14:44 by zs92450
[考研] 245求调剂 +6 冰糖橘?汽水 2026-04-13 10/500 2026-04-14 10:49 by jyl0317
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +24 叶zilin 2026-04-13 25/1250 2026-04-14 09:20 by 试管破裂
信息提示
请填处理意见