应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » [求助]利用Shell脚本进行VASP计算
91/1返回列表
查看: 1041  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

zongyan

铁杆木虫 (正式写手)

[交流] [求助]利用Shell脚本进行VASP计算

我根据侯柱峰写的教程中的脚本进行截断能的测试，但是一运行以后就停在done处，各位是否经历过，请帮忙解决一下。以下是脚本：

#!/bin/bash
BIN= ~/vasp
rm WAVECAR
for i in 150 200 250 300 350 400
do
cat > INCAR < System = Si-Diamond
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ENCUT = $i
ISMEAR = -5
PERC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i eV"; time vasp
E = 'grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5}'
echo $i $E >> comment
done

[ Last edited by wuchenwf on 2009-6-22 at 22:13 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
细推物理须行乐,何用浮名绊此生!
1楼 2008-12-31 19:28:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

TIGERYZZ

金虫 (小有名气)
★ ★
fegg7502(金币+2,VIP+0):鼓励讨论！
楼主可不可以把出错的文字贴出来，或者描述的详细一点啊，
脚本运行后停在最后一行语句done处，难道有问题吗？
赞一下(10人) 回复此楼
2楼2008-12-31 20:06:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zongyan

铁杆木虫 (正式写手)
没有出错信息，只是停在done位置上不去了，一般来说如果脚本正确的话，当运行完脚本后就会出来vasp的运算信息的，可是这个脚本就不行，一直停着不动。
赞一下 回复此楼
细推物理须行乐,何用浮名绊此生!
3楼2009-01-01 09:19:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunray55

银虫 (小有名气)
★ ★
wuchenwf(金币+2,VIP+0):谢谢，新年快乐
请问楼主是串行还是并行还是单机？
前两者不能简单的用 #sh ***命令
赞一下(10人) 回复此楼
4楼2009-01-01 11:05:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
★ ★ ★
fegg7502(金币+3,VIP+0):thanks,haha
另外楼主的系统是什么，要是Ubuntu的话，还运行VASP的时候要有 ./vasp
赞一下(10人) 回复此楼
5楼2009-01-01 14:31:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

flywoud

至尊木虫 (正式写手)
有些深奥，慢慢学一下
赞一下 回复此楼
6楼2009-01-01 14:33:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuchenwf

荣誉版主 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by flywoud at 2009-1-1 14:33:
有些深奥，慢慢学一下

不深奥，
回复此楼
7楼2009-01-01 15:00:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cheerian

铜虫 (正式写手)
语法上没看出问题......
赞一下 回复此楼
8楼2009-01-01 15:24:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)
★ ★
fegg7502(金币+2):thank you very much! 1-23 16:00
我想所谓的问题应该是处在这句:
E = 'grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5}'
楼主应该在comment文件里面看不到输出的E值
正确的格式应该是:

E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f \n", $5}'`
请特别注意最后两个是不同的,一个',另外一个是`
赞一下(10人) 回复此楼
Life, Love, Laugh.
9楼2009-01-23 13:34:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zongyan 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[考研] 297，工科调剂?河南农业大学本科 +15 河南农业大学-能 2026-04-14 15/750 2026-04-20 12:39 by Equinoxhua
[考研] 337求调剂 +3 jyz04 2026-04-18 3/150 2026-04-20 12:24 by 研可安
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 通信工程求调剂！！！ +7 zlb770521 2026-04-14 7/350 2026-04-19 20:56 by Equinoxhua
[考研] 297，工科调剂? +11 河南农业大学-能 2026-04-14 11/550 2026-04-19 20:07 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 320求调剂 +5 深郊akm 2026-04-17 5/250 2026-04-18 19:52 by 王珺璞
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 297，工科调剂? +5 河南农业大学-能 2026-04-14 5/250 2026-04-18 15:17 by Equinoxhua
[考研] 22408 312求调剂 +24 门路摸摸 2026-04-14 26/1300 2026-04-18 13:04 by wunaiy88
[考研] 急需调剂 +9 绝不放弃22 2026-04-15 10/500 2026-04-18 08:09 by chixmc
[考研] 一志愿中科大材料与化工，353分还有调剂学校吗 +10 否极泰来2026 2026-04-15 12/600 2026-04-17 17:54 by mapenggao
[考研] 295分求调剂 +5 ?要上岸? 2026-04-17 5/250 2026-04-17 16:51 by fenglj492
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
[考研] 一志愿沪9，生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[考研] 考研调剂 +13 长弓傲 2026-04-13 14/700 2026-04-14 14:44 by zs92450
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +24 叶zilin 2026-04-13 25/1250 2026-04-14 09:20 by 试管破裂
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭