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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 基因匹配问题，请大神指教
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雪域独舞

银虫 (初入文坛)

[求助] 基因匹配问题，请大神指教 已有1人参与

有一条克隆出来的已知序列信息的基因，想要从转录组基因库里面找出跟已知基因匹配度最高的基因，该用什么方法呢？有什么软件可以用吗？请大神帮忙，感谢！
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1楼 2017-04-01 16:43:51
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宁文峰

新虫 (小有名气)
直接去NCBI   blst就好了

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所追求的不在明天，而在现在以前
2楼2017-04-01 17:21:53
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-04-02 08:32:58
你说的转录组基因库是在线的还是本地的？在线的就用NCBI的blast，限定物种及数据库；如果是本地，直接用单机版blast。

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3楼2017-04-02 01:30:11
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雪域独舞

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2017-04-02 01:30:11
你说的转录组基因库是在线的还是本地的？在线的就用NCBI的blast，限定物种及数据库；如果是本地，直接用单机版blast。

谢谢回答，转录组基因库是本地的，单机版BLAST可以说的详细一些吗？
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4楼2017-04-06 08:57:12
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雪域独舞

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 宁文峰 at 2017-04-01 17:21:53
直接去NCBI   blst就好了

谢谢回答，但是我的转录组基因库是本地的，不是在线的，所以不知道有什么软件可以筛选？
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5楼2017-04-06 08:58:32
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