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雪域独舞

银虫 (初入文坛)

[求助] 基因匹配问题,请大神指教 已有1人参与

有一条克隆出来的已知序列信息的基因,想要从转录组基因库里面找出跟已知基因匹配度最高的基因,该用什么方法呢?有什么软件可以用吗?请大神帮忙,感谢!
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宁文峰

新虫 (小有名气)

所追求的不在明天,而在现在以前
2楼2017-04-01 17:21:53
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-04-02 08:32:58
你说的转录组基因库是在线的还是本地的?在线的就用NCBI的blast,限定物种及数据库;如果是本地,直接用单机版blast。

发自小木虫Android客户端
3楼2017-04-02 01:30:11
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雪域独舞

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2017-04-02 01:30:11
你说的转录组基因库是在线的还是本地的?在线的就用NCBI的blast,限定物种及数据库;如果是本地,直接用单机版blast。

谢谢回答,转录组基因库是本地的,单机版BLAST可以说的详细一些吗?
4楼2017-04-06 08:57:12
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雪域独舞

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 宁文峰 at 2017-04-01 17:21:53
直接去NCBI   blst就好了

谢谢回答,但是我的转录组基因库是本地的,不是在线的,所以不知道有什么软件可以筛选?
5楼2017-04-06 08:58:32
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