| 查看: 619 | 回复: 2 | |||
18235149572新虫 (小有名气)
|
[求助]
做硝化反应的过渡态。。。怎么以原子间的距离为反应坐标？ 已有1人参与
|
|
The distance between the nitrogen atom of the nitronium ion and the attacked carbon atom was chosen as the reaction coordinate (RC). Points of the reaction profile were obtained by freezing the reaction coordinate and optimizing the rest of the internal coordinates simultaneously. 看了一篇文献提到以距离为反应坐标，箱试一下但不知道怎么输入，希望大神给个指点  |
回复此楼» 猜你喜欢
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有118人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有1人回复
-
实际气体内压强的微观机制或将改写--------从一个基本的力学佯谬说起
已经有1人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有5人回复
-
招收0703开头的学硕调剂生 线上复试
已经有4人回复
paramecium86
版主 (著名写手)
- QC强帖: 5
- 应助: 588 (博士)
- 贵宾: 0.01
- 金币: 26433.6
- 红花: 349
- 帖子: 2026
- 在线: 1446.2小时
- 虫号: 2466443
- 注册: 2013-05-16
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
18235149572: 金币+10, ★★★很有帮助 2017-04-01 15:36:15
感谢参与，应助指数 +1
18235149572: 金币+10, ★★★很有帮助 2017-04-01 15:36:15
|
既然说了'by freezing the reaction coordinate, and rest of the internal coordinates' 也就是说应该使用了 opt=modredundant 做了柔性扫描。 之前又说用氮原子距离作为reaction coordinate 也就是说沿着 N-N 作为柔性扫描。比如说 %chk=... %mem=... %nproc=... # opt=modredundant b3lyp/6-311g title 0 1 N 0.0 0.0 0.0 N 1.0 1.0 1.0 H 2.0 2.0 2.0 B 1 2 S 100 0.05 (从初始N-N距离开始，每0.05埃 算一次opt，算100个点 ） 这样扫出来一根势能曲线 那么顶点就是过渡态大概的样子。 |
2楼2017-03-31 21:29:29
18235149572
新虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 61.2
- 散金: 71
- 红花: 2
- 帖子: 119
- 在线: 69.5小时
- 虫号: 4217754
- 注册: 2015-11-13
- 性别: GG
- 专业: 有机化学
3楼2017-04-01 16:11:33
