| 查看: 599 | 回复: 2 | ||
18235149572新虫 (小有名气)
|
[求助]
做硝化反应的过渡态。。。怎么以原子间的距离为反应坐标？ 已有1人参与
|
|
The distance between the nitrogen atom of the nitronium ion and the attacked carbon atom was chosen as the reaction coordinate (RC). Points of the reaction profile were obtained by freezing the reaction coordinate and optimizing the rest of the internal coordinates simultaneously. 看了一篇文献提到以距离为反应坐标，箱试一下但不知道怎么输入，希望大神给个指点  |
回复此楼» 猜你喜欢
华南师范大学广州市光谱分析与功能探针重点实验室诚招青年英才和博士后岗位研究人员
已经有10人回复
-
已知面上挂了，小学校实验方向无平台，感觉太难了
已经有26人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有228人回复
-
求助各位大佬，球球了，在这科萨头
已经有0人回复
-
求标准卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340
已经有2人回复
-
量子点电致发光器件（QLED）：蓝光量子点（QDs）和纳米氧化锌电子传输材料
已经有0人回复
-
七嗪类物质合成求助
已经有0人回复
-
需要一个圆偏振光诱导化学反应，请问使用圆偏振光作为光源，应该需要哪些设备搭建
已经有0人回复
-
求ENDNOTE破解软件安装包
已经有4人回复
-
河海大学 （211.双一流高校）钙钛矿光电实验室丁勇团队欢迎有志青年！
已经有3人回复
-
黑龙江省原子能研究院化学课题组招收2026级化学专业或化学相关专业硕士生
已经有0人回复
paramecium86
版主 (著名写手)
- QC强帖: 5
- 应助: 588 (博士)
- 贵宾: 0.01
- 金币: 26423.6
- 红花: 349
- 帖子: 2026
- 在线: 1442.8小时
- 虫号: 2466443
- 注册: 2013-05-16
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
- 管辖: 量子化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
18235149572: 金币+10, ★★★很有帮助 2017-04-01 15:36:15
感谢参与，应助指数 +1
18235149572: 金币+10, ★★★很有帮助 2017-04-01 15:36:15
|
既然说了'by freezing the reaction coordinate, and rest of the internal coordinates' 也就是说应该使用了 opt=modredundant 做了柔性扫描。 之前又说用氮原子距离作为reaction coordinate 也就是说沿着 N-N 作为柔性扫描。比如说 %chk=... %mem=... %nproc=... # opt=modredundant b3lyp/6-311g title 0 1 N 0.0 0.0 0.0 N 1.0 1.0 1.0 H 2.0 2.0 2.0 B 1 2 S 100 0.05 (从初始N-N距离开始，每0.05埃 算一次opt，算100个点 ） 这样扫出来一根势能曲线 那么顶点就是过渡态大概的样子。 |
2楼2017-03-31 21:29:29
18235149572
新虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 61.2
- 散金: 71
- 红花: 2
- 帖子: 119
- 在线: 69.5小时
- 虫号: 4217754
- 注册: 2015-11-13
- 性别: GG
- 专业: 有机化学
3楼2017-04-01 16:11:33
