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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物化学 » 启动子序列
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椰子

新虫 (小有名气)

[求助] 启动子序列 已有1人参与

一个基因的启动子序列怎么查找啊，还有就是调节基因是不是又有启动子又要有操纵子啊，各个序列怎么找啊，各位大虾帮帮忙，十分感谢

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1楼 2017-03-23 17:13:03
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

奋斗o小青年

新虫 (正式写手)
取基因CDS区上游3000bp左右的序列，然后在NCBI上找到相近物种的启动子基因序列做blast比对，找到启动子调节区，然后通过在线分析软件，寻找核心启动子调控区

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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

椰子
5楼2018-06-03 23:06:49
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Crazy cat

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
椰子: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2018-06-06 10:05:34
椰子: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2018-06-06 19:42:31
基因CDS区上游2000bp就是了，找到之后用分析软件找到核心启动子区间就可以了
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6楼2018-06-04 11:40:31
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雪晴松竹

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
2楼2017-11-07 20:40:01
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雪晴松竹

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
3楼2017-11-07 20:40:03
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maofuchao

新虫 (初入文坛)
你的问题解决了吗？你是如何查找的？
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4楼2018-06-03 18:07:04
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椰子

新虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 奋斗o小青年 at 2018-06-03 23:06:49
取基因CDS区上游3000bp左右的序列，然后在NCBI上找到相近物种的启动子基因序列做blast比对，找到启动子调节区，然后通过在线分析软件，寻找核心启动子调控区

谢谢

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7楼2018-06-06 10:04:28
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椰子

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by Crazy cat at 2018-06-04 11:40:31
基因CDS区上游2000bp就是了，找到之后用分析软件找到核心启动子区间就可以了

请问用什么分析软件啊

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8楼2018-06-06 10:05:52
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椰子

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by maofuchao at 2018-06-03 18:07:04
你的问题解决了吗？你是如何查找的？

你试试五楼和六楼的方法，我还没有尝试

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9楼2018-06-06 10:06:28
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椰子

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 雪晴松竹 at 2017-11-07 20:40:03
你的问题解决了嘛？

五楼和六楼的方法还没有尝试，应该是可以的，最近做其他实验了

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10楼2018-06-06 10:07:18
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