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柠檬可乐星

新虫 (小有名气)

[求助] 求大神指导这个PCR程序是如何设置的已有2人参与

如题,最近读的一篇文献里我的目的片段扩增程序是这样的:SSU rDNA was amplified by PCR in a total volume of 50ul. The thermal cycle parameters consisted of 40 cycles of 30 s at 94℃, 30 s at 50℃ and 120 s at 72℃, followed by 5 min at 72℃ for final extension. Partial SSU rDNA sequences were obtained by amplification with the primer pairs s14F3-s17 and s14F3-sB (primers described in Pawlowski, 2000). The obtained PCR products were used for reamplification with the primer pairs s14F1–s17 and s14F1–sB, using the same thermal cycle parameters during 25 cycles.

引物位置如下图

那么问题来了,在 amplification 的时候,s14F3-s17 and s14F3-sB (同理, s14F1–s17 and s14F1–sB)这两对引物是同时加到50ul的PCR体系里吗?

之前没见过这种写法的,实在搞不明白这个PCR程序是怎么设置的,还请各位大神指导一二,多谢!!!

求大神指导这个PCR程序是如何设置的
捕获.PNG
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柠檬可乐星

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by bbqlhb at 2017-03-21 16:42:48
已写得很明白,第一次40个循环扩增引物 s14F3-s17 和s14F3-sB 。
第二次用第一次的产物,同样体系,25个循环扩增引物s14F1–s17 和 s14F1–sB

请问是把引物s14F3-s17 和s14F3-sB同时加到 50ul体系中,进行40个循环吗?

我没有见过体系里同时加一对半巢式PCR引物的反应,所以不敢确定,谢谢
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9楼2017-03-21 16:50:28
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痞子无敌

金虫 (正式写手)

问题是 这两对引物分别用来扩增什么

发自小木虫IOS客户端
当你当你的眼睛眯着笑
2楼2017-03-20 22:11:36
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柠檬可乐星

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 痞子无敌 at 2017-03-20 22:11:36
问题是 这两对引物分别用来扩增什么

扩增18s的一个片段
越努力越幸运
3楼2017-03-21 08:09:01
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痞子无敌

金虫 (正式写手)

去找那篇2000年的文献啊

发自小木虫IOS客户端
当你当你的眼睛眯着笑
4楼2017-03-21 10:43:48
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